219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6636 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
457 aa  926    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  49.88 
 
 
453 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  35.53 
 
 
451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  36.79 
 
 
453 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  35.87 
 
 
500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  30.65 
 
 
449 aa  199  9e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  38.57 
 
 
462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  33.66 
 
 
463 aa  183  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  37.69 
 
 
453 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  34.36 
 
 
465 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  37.32 
 
 
462 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  35.18 
 
 
443 aa  173  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  29.89 
 
 
449 aa  172  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  31.77 
 
 
441 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  30.59 
 
 
446 aa  169  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  29.02 
 
 
446 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  31.13 
 
 
441 aa  166  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  39.1 
 
 
456 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  32.38 
 
 
463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  33.89 
 
 
454 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  31.56 
 
 
456 aa  159  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  27.44 
 
 
446 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  33.7 
 
 
458 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  25.43 
 
 
490 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  30.41 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  30.84 
 
 
488 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  29.29 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  29.81 
 
 
482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  31.17 
 
 
451 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  34.94 
 
 
442 aa  141  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  33.02 
 
 
442 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  31.7 
 
 
443 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  28.74 
 
 
444 aa  139  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  35.9 
 
 
482 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  29.91 
 
 
456 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  32.46 
 
 
451 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  34.53 
 
 
439 aa  136  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  29.77 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  31.6 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  30.9 
 
 
481 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  30.7 
 
 
483 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  31.77 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  31.87 
 
 
451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  29.57 
 
 
450 aa  130  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  32.1 
 
 
449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  28.22 
 
 
501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0678  MmgE/PrpD family protein  34.38 
 
 
444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3559  MmgE/PrpD family protein  33.59 
 
 
442 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.595946  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  26.83 
 
 
471 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  32.11 
 
 
503 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  32.79 
 
 
468 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  31.37 
 
 
503 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  31.37 
 
 
503 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  31.91 
 
 
486 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  33.33 
 
 
457 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  26.86 
 
 
460 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  33.67 
 
 
456 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  27.59 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  29.55 
 
 
461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  29.1 
 
 
450 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  33.53 
 
 
454 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  31.31 
 
 
477 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.35 
 
 
461 aa  117  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  32.31 
 
 
458 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  25.67 
 
 
481 aa  114  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  29.06 
 
 
481 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  31.22 
 
 
460 aa  113  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  28.68 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  32.22 
 
 
455 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  26.08 
 
 
472 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  29.35 
 
 
476 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  31.87 
 
 
472 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  28.14 
 
 
449 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  29.78 
 
 
450 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  30.81 
 
 
468 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  28.98 
 
 
450 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  29.76 
 
 
450 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  31.54 
 
 
462 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.64 
 
 
465 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  27.88 
 
 
467 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  30.61 
 
 
464 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  28.24 
 
 
474 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  33.14 
 
 
458 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  30.95 
 
 
468 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  28.8 
 
 
461 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  29.85 
 
 
461 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  30.12 
 
 
457 aa  99.8  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3409  MmgE/PrpD family protein  29.9 
 
 
455 aa  99.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  29.56 
 
 
453 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  28.41 
 
 
458 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  26.85 
 
 
453 aa  97.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  31.02 
 
 
454 aa  96.7  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  29.62 
 
 
464 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  31.25 
 
 
459 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  31.09 
 
 
494 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  28.74 
 
 
470 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0288  putative MmgE/PrpD family protein  28.21 
 
 
456 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  28.47 
 
 
458 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2428  MmgE/PrpD  31.18 
 
 
404 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0639632  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  29.41 
 
 
454 aa  94  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>