150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3057 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 450 aa  923    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  41 
 
 		 441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  42.79 
 
 		 456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  37.5 
 
 		 453 aa  299  7e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  41.09 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  28 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  28.19 
 
 		 451 aa  131  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  26.96 
 
 		 451 aa  129  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  26.13 
 
 		 467 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  25.75 
 
 		 456 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  23.75 
 
 		 501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7496  MmgE/PrpD family protein  25.22 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000196116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  25.55 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  25.97 
 
 		 449 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0572  MmgE/PrpD family protein  29.2 
 
 		 457 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  25.28 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  27.68 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  26.56 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  24.73 
 
 		 463 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2474  MmgE/PrpD family protein  26.19 
 
 		 444 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288716  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  24.44 
 
 		 470 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  25.11 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  24.61 
 
 		 470 aa  103  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  25 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  24.28 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  23.95 
 
 		 446 aa  97.8  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  24.29 
 
 		 450 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  25.88 
 
 		 463 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1088  MmgE/PrpD family protein  24.2 
 
 		 472 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  25.71 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  24.12 
 
 		 446 aa  95.1  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  26.48 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  23.06 
 
 		 453 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  25.55 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  23.53 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  23.76 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  26.25 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  25.17 
 
 		 458 aa  91.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  22.83 
 
 		 446 aa  90.9  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  24.12 
 
 		 481 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  21.88 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  26.24 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  25.82 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  22.52 
 
 		 469 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2695  MmgE/PrpD family protein  24.39 
 
 		 469 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  24.73 
 
 		 456 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  23.04 
 
 		 449 aa  86.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  23.45 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  27.93 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  26.43 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  21.61 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  25.71 
 
 		 503 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  26.04 
 
 		 503 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  24.67 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  24.53 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  25.23 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  25.75 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  25.71 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  25.48 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  26.71 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  26.06 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  23.8 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  25.38 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  24.23 
 
 		 455 aa  83.2  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  24.67 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  26.42 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  27.8 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  24.66 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  25.78 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  24.26 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  24.86 
 
 		 451 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  22.94 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  24.48 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  21.86 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  27.88 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  24.54 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  23.61 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  23.61 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  24.28 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  21.49 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  24.59 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  26.84 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  24.34 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  24.03 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  23.15 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  26.5 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  24.39 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  26.39 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  23.33 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  25.37 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  23.62 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  26.09 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  21.51 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  21.99 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  21.44 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  25.85 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  25.05 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  23.44 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  22.86 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>