202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1004 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  100 
 
 
458 aa  926    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  44 
 
 
482 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  37.53 
 
 
456 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  32.32 
 
 
455 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  34.7 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  31.07 
 
 
457 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  30.52 
 
 
488 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  32.41 
 
 
456 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  29.55 
 
 
483 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  33.33 
 
 
463 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  28.95 
 
 
482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  35.44 
 
 
453 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  37.27 
 
 
451 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  35.2 
 
 
453 aa  170  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  33.6 
 
 
462 aa  170  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  29.31 
 
 
481 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  30.43 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  38.32 
 
 
462 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  34.74 
 
 
453 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  33.7 
 
 
457 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  31.25 
 
 
500 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  31.79 
 
 
463 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  38.87 
 
 
454 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  37.92 
 
 
443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  30.73 
 
 
456 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  31.8 
 
 
458 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  31.57 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  30.28 
 
 
441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  32.11 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  31.83 
 
 
451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  38.18 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  30.65 
 
 
450 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  32.76 
 
 
443 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  28.92 
 
 
490 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  30.72 
 
 
449 aa  140  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  31.24 
 
 
454 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  27.98 
 
 
456 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  29.77 
 
 
468 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  28.87 
 
 
441 aa  136  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  34.05 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  30.07 
 
 
501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  30.52 
 
 
455 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  31.56 
 
 
444 aa  133  6e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  30.83 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3559  MmgE/PrpD family protein  39.06 
 
 
442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.595946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  30.43 
 
 
450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  38.01 
 
 
439 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  31.14 
 
 
460 aa  130  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  33.57 
 
 
447 aa  129  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  33.23 
 
 
462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  32.34 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  31.15 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  30.03 
 
 
449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 
458 aa  126  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  30.56 
 
 
461 aa  126  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  31.4 
 
 
462 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  32.95 
 
 
465 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  32.68 
 
 
463 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  32.68 
 
 
464 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  30.34 
 
 
471 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  30.85 
 
 
474 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  28.12 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  32.56 
 
 
459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  31.89 
 
 
442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  30.26 
 
 
467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  30.65 
 
 
449 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  32.01 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  30.64 
 
 
454 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  30.44 
 
 
486 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0678  MmgE/PrpD family protein  41.04 
 
 
444 aa  117  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  34.76 
 
 
447 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  30.58 
 
 
494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  31.15 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  25.22 
 
 
453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  29.66 
 
 
472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  33.86 
 
 
461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  27.44 
 
 
481 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  29.35 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  31.11 
 
 
458 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  33.53 
 
 
461 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  28.23 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  32.47 
 
 
454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  30.67 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  30.88 
 
 
457 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  31.87 
 
 
503 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  32.16 
 
 
503 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  32.16 
 
 
503 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  31.53 
 
 
451 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0288  putative MmgE/PrpD family protein  29.71 
 
 
456 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  29.43 
 
 
477 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7308  MmgE/PrpD  30.35 
 
 
504 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  25.43 
 
 
469 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.61 
 
 
461 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  27.98 
 
 
470 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  30.64 
 
 
464 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  26.82 
 
 
449 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  28.18 
 
 
481 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  28.54 
 
 
470 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  31.38 
 
 
468 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  28.91 
 
 
450 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>