185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3608 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 468 aa  947    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  32.89 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  32.39 
 
 		 456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  31.31 
 
 		 456 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  31.46 
 
 		 451 aa  187  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  31.24 
 
 		 481 aa  186  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  30.85 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  32.53 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  32.97 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  30.65 
 
 		 483 aa  183  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  27.9 
 
 		 446 aa  178  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  30.07 
 
 		 482 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  30.63 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  30.63 
 
 		 457 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  30.53 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  31.4 
 
 		 455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  31.47 
 
 		 460 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  31.85 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  35.41 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  30.02 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  30.07 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  28.18 
 
 		 449 aa  170  6e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  32.47 
 
 		 461 aa  170  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  26.88 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  28.88 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  30.87 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  27.09 
 
 		 446 aa  167  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  30.93 
 
 		 481 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  31.14 
 
 		 454 aa  166  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  31.55 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  31.35 
 
 		 456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  31.82 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  30.05 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  31.28 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  31.67 
 
 		 453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  31.4 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  29.74 
 
 		 474 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  31.1 
 
 		 486 aa  163  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  27.83 
 
 		 488 aa  163  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  31.75 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  31.52 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  31.75 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  31.18 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  31.36 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  28.2 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  28.64 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  29.7 
 
 		 462 aa  160  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  28.28 
 
 		 463 aa  159  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  30.46 
 
 		 463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  28.86 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  31.52 
 
 		 454 aa  154  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  30.45 
 
 		 464 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  28.29 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  30.45 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  28.45 
 
 		 449 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  31.47 
 
 		 476 aa  151  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  29.1 
 
 		 461 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  32.18 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  29.23 
 
 		 447 aa  150  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  27.23 
 
 		 504 aa  150  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.48 
 
 		 465 aa  150  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  30.06 
 
 		 460 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  31.98 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  27.33 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  30.83 
 
 		 458 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  30.8 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  28.5 
 
 		 462 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  28.64 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  29.47 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  27.22 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  26.2 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  32.78 
 
 		 443 aa  141  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  33.21 
 
 		 456 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  32.27 
 
 		 500 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  27.17 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  34.21 
 
 		 468 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  29.66 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  33.59 
 
 		 482 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  30.47 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  28.63 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  31.11 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  32.02 
 
 		 462 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  29.75 
 
 		 485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  28.11 
 
 		 472 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  29.77 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  28.44 
 
 		 460 aa  128  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  29.48 
 
 		 451 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  30.26 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  29.03 
 
 		 451 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  28.07 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  26.32 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  27.79 
 
 		 491 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  27.79 
 
 		 491 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  27.79 
 
 		 491 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  29.82 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  31.42 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  27.13 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  28.44 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  27.29 
 
 		 492 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  27.29 
 
 		 492 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>