190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1760 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 445 aa  889    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  73.68 
 
 		 442 aa  585  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  58.92 
 
 		 443 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  55.22 
 
 		 477 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  51.15 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  36.57 
 
 		 451 aa  239  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  35.43 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  35.19 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  35.2 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  34.98 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  36.04 
 
 		 454 aa  223  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  35.99 
 
 		 454 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  34.77 
 
 		 462 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  32.21 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  33.56 
 
 		 454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  33.56 
 
 		 459 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  33.33 
 
 		 457 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  31.76 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  34.33 
 
 		 460 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  35.18 
 
 		 461 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  31.35 
 
 		 463 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  34.24 
 
 		 463 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  34.24 
 
 		 464 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  33.86 
 
 		 494 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  36.59 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  32.11 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  34.77 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  35.44 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  36.14 
 
 		 458 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  35.17 
 
 		 476 aa  177  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  36.84 
 
 		 447 aa  172  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  32.64 
 
 		 455 aa  172  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  29 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  35.48 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  33.7 
 
 		 456 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  33.8 
 
 		 488 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  34.38 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  31.1 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  35.07 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  34.13 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  32.29 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  31.77 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  31.61 
 
 		 457 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  34.26 
 
 		 482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  31.49 
 
 		 450 aa  156  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  31.74 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  28.83 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  37.24 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  31.61 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  32.19 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  33.76 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  25.44 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  32.33 
 
 		 462 aa  153  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  25.66 
 
 		 446 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  29.07 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  35.85 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  26.23 
 
 		 446 aa  150  5e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  34.16 
 
 		 483 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  29.95 
 
 		 463 aa  150  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  31.33 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 453 aa  146  6e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  29.31 
 
 		 453 aa  146  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 451 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  32.35 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  34.34 
 
 		 482 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  33.61 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  26.91 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  37.05 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  30.86 
 
 		 461 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  32.2 
 
 		 461 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  29.15 
 
 		 453 aa  140  7e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  30.55 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  33.51 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  29.24 
 
 		 470 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  28.79 
 
 		 460 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  28.83 
 
 		 490 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  29.26 
 
 		 441 aa  136  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.23 
 
 		 461 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  31.42 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  33.48 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  32.05 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  30.85 
 
 		 450 aa  134  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  32.99 
 
 		 503 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  32.99 
 
 		 503 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  30.17 
 
 		 453 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  28.5 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  35.03 
 
 		 471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  24.88 
 
 		 449 aa  131  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  28.29 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  30.49 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  30.08 
 
 		 474 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  29.15 
 
 		 460 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  27.74 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  27.99 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  27.75 
 
 		 441 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  26.08 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  30.53 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>