185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6148 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 442 aa  879    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  73.35 
 
 		 445 aa  584  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  61.87 
 
 		 443 aa  478  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  56.93 
 
 		 477 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  55.45 
 
 		 451 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  37.16 
 
 		 450 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  36.22 
 
 		 449 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  36.94 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  36.7 
 
 		 451 aa  246  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  35.31 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  35.8 
 
 		 454 aa  226  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  35.15 
 
 		 459 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  32.88 
 
 		 458 aa  223  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  35.4 
 
 		 454 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  32.8 
 
 		 501 aa  219  7.999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  34.7 
 
 		 457 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  35.46 
 
 		 462 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  34.86 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  35.59 
 
 		 454 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  33.72 
 
 		 460 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  35.4 
 
 		 476 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  30.07 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  33.26 
 
 		 462 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  34.93 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  38.33 
 
 		 458 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  34.93 
 
 		 464 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  31.12 
 
 		 457 aa  189  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  38.5 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  33.03 
 
 		 455 aa  186  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  36.06 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  30.05 
 
 		 463 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  33.89 
 
 		 494 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  33.94 
 
 		 453 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  27.41 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  31.53 
 
 		 463 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  29.44 
 
 		 456 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  31.97 
 
 		 468 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  34 
 
 		 456 aa  171  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  24.94 
 
 		 446 aa  170  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  26.05 
 
 		 446 aa  169  6e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  31.82 
 
 		 451 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  32.89 
 
 		 485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  35.45 
 
 		 458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  33.02 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  30.43 
 
 		 488 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  37.78 
 
 		 456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  33.11 
 
 		 467 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  32.81 
 
 		 450 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  32.2 
 
 		 482 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  31.49 
 
 		 483 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  29.35 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  32.04 
 
 		 481 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  33.86 
 
 		 500 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  31.56 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  37.53 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  31.35 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  35.23 
 
 		 503 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  29.69 
 
 		 457 aa  153  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  31.49 
 
 		 457 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  33.19 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  31.63 
 
 		 454 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.65 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  34.72 
 
 		 503 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  30.82 
 
 		 470 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  34.72 
 
 		 503 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  32.21 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  31.93 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  32.13 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  31.89 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  35.12 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  31.99 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  30.95 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  32.44 
 
 		 455 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  37.39 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  29.49 
 
 		 453 aa  144  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  31.28 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  29.46 
 
 		 441 aa  142  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  32.06 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  30.67 
 
 		 471 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  31.64 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  25.54 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  29.93 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  27.14 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  29.91 
 
 		 489 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  33.89 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  28.67 
 
 		 460 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  31.01 
 
 		 453 aa  136  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  34.44 
 
 		 471 aa  136  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  28.54 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  29.74 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  26.73 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  27.82 
 
 		 490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  28.5 
 
 		 460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  30.56 
 
 		 461 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  30.66 
 
 		 451 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  30.34 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  30.34 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>