186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3206 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
471 aa  918    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 
501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  33.16 
 
 
459 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  32.39 
 
 
457 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  33.14 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  34.83 
 
 
454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  30.86 
 
 
450 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  31.26 
 
 
454 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  35.07 
 
 
454 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  32.74 
 
 
460 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  33.94 
 
 
454 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  30.08 
 
 
450 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  27.53 
 
 
449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  30.95 
 
 
449 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  31.91 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  32.75 
 
 
443 aa  147  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 
442 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  30.4 
 
 
458 aa  144  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  30 
 
 
451 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  31.9 
 
 
463 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  32.58 
 
 
464 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  33.85 
 
 
445 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  30.89 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  31.73 
 
 
476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  34.2 
 
 
462 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  31.05 
 
 
481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  32.03 
 
 
461 aa  131  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  33.51 
 
 
494 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  28.17 
 
 
456 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  25 
 
 
446 aa  124  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  24.82 
 
 
449 aa  123  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  29.64 
 
 
455 aa  123  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  26.14 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  36.14 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  30.37 
 
 
485 aa  119  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  25.2 
 
 
446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  29.67 
 
 
359 aa  118  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  33.72 
 
 
456 aa  116  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  29.2 
 
 
474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  27.14 
 
 
460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  29.88 
 
 
470 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  31.23 
 
 
468 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  30.26 
 
 
477 aa  113  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  28.67 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  27.99 
 
 
457 aa  110  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  28.31 
 
 
453 aa  110  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  32.33 
 
 
461 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  29.4 
 
 
481 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  28.86 
 
 
470 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  28.9 
 
 
483 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  28.18 
 
 
488 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  32.09 
 
 
455 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  26.57 
 
 
471 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  30.89 
 
 
476 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  27.14 
 
 
468 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  36.13 
 
 
458 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  34.68 
 
 
449 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  30.41 
 
 
454 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  29.84 
 
 
482 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  31.78 
 
 
457 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  30.12 
 
 
456 aa  103  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  29.65 
 
 
458 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  31.78 
 
 
462 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  31.22 
 
 
485 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  27.76 
 
 
457 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  29.4 
 
 
504 aa  100  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  29.98 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1027  MmgE/PrpD family protein  26.06 
 
 
458 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  29.7 
 
 
450 aa  99  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  35.71 
 
 
453 aa  97.8  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  25.8 
 
 
463 aa  97.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  26.06 
 
 
521 aa  97.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  27.62 
 
 
456 aa  97.1  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  31.36 
 
 
468 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  28.28 
 
 
453 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  25.77 
 
 
490 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  31.23 
 
 
458 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  27.6 
 
 
453 aa  94.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  29.5 
 
 
482 aa  94  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  24.39 
 
 
450 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  32.1 
 
 
465 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.91 
 
 
458 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  27.46 
 
 
450 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  26.18 
 
 
460 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  26.87 
 
 
453 aa  90.5  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  31.14 
 
 
451 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  28.65 
 
 
500 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  32.83 
 
 
439 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  26.74 
 
 
460 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  30.38 
 
 
458 aa  88.2  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  30.51 
 
 
465 aa  87.8  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  28.32 
 
 
489 aa  87  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  30.37 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  28.53 
 
 
503 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  27.4 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  28.53 
 
 
503 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  30.09 
 
 
451 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  29.67 
 
 
451 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  28.2 
 
 
503 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  28.91 
 
 
461 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>