165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1089 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 441 aa  863    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  43.72 
 
 		 467 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  40.05 
 
 		 454 aa  203  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7947  MmgE/PrpD family protein  37.37 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  31.82 
 
 		 451 aa  153  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  31.78 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  27.51 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1088  MmgE/PrpD family protein  32.73 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  29.93 
 
 		 501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  31.31 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  31.41 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  29.25 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  33.01 
 
 		 460 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  31.02 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  32.23 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  32.23 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  31.66 
 
 		 456 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  30.61 
 
 		 455 aa  126  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  30.28 
 
 		 486 aa  126  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  28.82 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  32.94 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  30.3 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  30.81 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  29.18 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  27.97 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  25.28 
 
 		 450 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  29.28 
 
 		 456 aa  116  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  28.95 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  29.7 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  31.41 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  31.53 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  31.68 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  29.21 
 
 		 443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  28.94 
 
 		 450 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  30.34 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  28.1 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  29.36 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  29.23 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  27.49 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  30.27 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  29.02 
 
 		 454 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  29.91 
 
 		 494 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  29.38 
 
 		 449 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  27.36 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  30.67 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  29.74 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  30.23 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2695  MmgE/PrpD family protein  29.12 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  30.53 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  23.56 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  24.12 
 
 		 481 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  28.54 
 
 		 481 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  28.78 
 
 		 482 aa  107  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  30.93 
 
 		 453 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  30.5 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  29.4 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  31.26 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  29.89 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  27.44 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  29.44 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7496  MmgE/PrpD family protein  27.46 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000196116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  29.08 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  28.57 
 
 		 458 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  29.35 
 
 		 463 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  27.91 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  28.41 
 
 		 453 aa  103  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  33.14 
 
 		 468 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  28.86 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  28.64 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  29.4 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  26.24 
 
 		 441 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  29.5 
 
 		 461 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  27.23 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  27.72 
 
 		 460 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  26.03 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  29.67 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  31.69 
 
 		 451 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  29.36 
 
 		 462 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  28.8 
 
 		 461 aa  98.2  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  29.81 
 
 		 503 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  24.24 
 
 		 446 aa  97.4  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  29.81 
 
 		 503 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  30.84 
 
 		 500 aa  97.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  23.3 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  29.51 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  27.29 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  33.62 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  26.03 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.61 
 
 		 465 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0572  MmgE/PrpD family protein  31.99 
 
 		 457 aa  93.6  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  29.44 
 
 		 476 aa  93.6  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  27.64 
 
 		 453 aa  93.6  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  31.04 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  28.47 
 
 		 453 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  28.11 
 
 		 482 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  27.46 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2474  MmgE/PrpD family protein  29.88 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288716  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  32.09 
 
 		 454 aa  90.5  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  28.3 
 
 		 461 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  27.9 
 
 		 453 aa  90.9  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>