180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0116 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  85.65 
 
 
454 aa  746    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
454 aa  913    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  98.02 
 
 
454 aa  897    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  71.96 
 
 
454 aa  615  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  73.98 
 
 
461 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  73.01 
 
 
462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  73.76 
 
 
476 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  66.82 
 
 
458 aa  549  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  65.15 
 
 
462 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  65.6 
 
 
494 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  60.41 
 
 
449 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  59.82 
 
 
450 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  64.14 
 
 
463 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  64.14 
 
 
464 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  59.14 
 
 
450 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  61.78 
 
 
457 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  60.67 
 
 
459 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  56.5 
 
 
460 aa  455  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  70.14 
 
 
359 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  48.05 
 
 
501 aa  419  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  39.05 
 
 
451 aa  292  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  34.86 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  35.25 
 
 
442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  35.02 
 
 
451 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  36.03 
 
 
443 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  37 
 
 
455 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  33.79 
 
 
445 aa  197  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  35.33 
 
 
456 aa  196  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  36.01 
 
 
447 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  36.88 
 
 
454 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  29.74 
 
 
449 aa  190  4e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  35.25 
 
 
458 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  30.02 
 
 
456 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  28.73 
 
 
446 aa  187  5e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  30.64 
 
 
468 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  35.29 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  36.57 
 
 
458 aa  179  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 
488 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  27.71 
 
 
446 aa  177  4e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  28.37 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  32.88 
 
 
481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  31.81 
 
 
455 aa  170  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  32.63 
 
 
456 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  32.19 
 
 
483 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  32.84 
 
 
451 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  32.69 
 
 
463 aa  166  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  33.04 
 
 
470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  29.98 
 
 
490 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  33.73 
 
 
470 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  28.6 
 
 
453 aa  160  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  34.39 
 
 
467 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  33.55 
 
 
450 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  33.88 
 
 
453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  31.65 
 
 
481 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  32.61 
 
 
463 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  29.98 
 
 
482 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  34.9 
 
 
471 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  31.33 
 
 
456 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  34.14 
 
 
482 aa  149  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 
476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  29.36 
 
 
481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  31.95 
 
 
461 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  31.98 
 
 
458 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  32.88 
 
 
503 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  31.53 
 
 
458 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  34.2 
 
 
477 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  32.46 
 
 
503 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  32.46 
 
 
503 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  33.83 
 
 
449 aa  143  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  29.95 
 
 
449 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  28.54 
 
 
504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.72 
 
 
461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  30.96 
 
 
458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  26.91 
 
 
469 aa  139  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  30.48 
 
 
453 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  33 
 
 
453 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  29.16 
 
 
471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  33.08 
 
 
468 aa  137  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  26.99 
 
 
460 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  28.57 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  34.65 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  28.4 
 
 
485 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  30.59 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  33.57 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  34.2 
 
 
468 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.16 
 
 
465 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  34.08 
 
 
447 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  31.54 
 
 
472 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  29.75 
 
 
441 aa  123  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  29.79 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  27.67 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2695  MmgE/PrpD family protein  29.33 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  27.09 
 
 
472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  29.95 
 
 
453 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  30.15 
 
 
461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  24.07 
 
 
449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  32.27 
 
 
464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  31.16 
 
 
457 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  29.08 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  25.23 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>