171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3898 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  91.61 
 
 		 457 aa  807    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  927    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  65.46 
 
 		 450 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  65.46 
 
 		 450 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  63.53 
 
 		 449 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  61.56 
 
 		 454 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  64.71 
 
 		 461 aa  530  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  64.62 
 
 		 462 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  60.62 
 
 		 462 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  58.5 
 
 		 458 aa  508  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  61.68 
 
 		 454 aa  501  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  59.87 
 
 		 494 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  60.77 
 
 		 454 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  60.05 
 
 		 463 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  60.05 
 
 		 464 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  63.53 
 
 		 476 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  60.67 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  56.86 
 
 		 460 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  46.19 
 
 		 501 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  59.94 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  40.78 
 
 		 451 aa  293  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  33.74 
 
 		 449 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  35.15 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  34.81 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  29.85 
 
 		 449 aa  206  7e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  35.96 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  30.48 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  30.24 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  34.34 
 
 		 456 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  37.31 
 
 		 455 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  29.23 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  35.07 
 
 		 454 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  33.64 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  34.11 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  33.85 
 
 		 450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  32.05 
 
 		 455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  35.07 
 
 		 458 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  33.87 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  30.75 
 
 		 468 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  34.98 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  31.1 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  29.75 
 
 		 481 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  35.35 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  30.96 
 
 		 488 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  31.77 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  31.63 
 
 		 453 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  29.26 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  34.19 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  34.22 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  32.16 
 
 		 458 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  33.65 
 
 		 456 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  33.19 
 
 		 482 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  31.5 
 
 		 453 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  32.12 
 
 		 470 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  32.08 
 
 		 470 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  29.63 
 
 		 482 aa  156  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  28.79 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  31.69 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  30.07 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  37.09 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  35.16 
 
 		 503 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  35.42 
 
 		 503 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  35.42 
 
 		 503 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  33.26 
 
 		 477 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  31.03 
 
 		 486 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  27.39 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  32.48 
 
 		 461 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  31.32 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  33.16 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  29.17 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  32.56 
 
 		 458 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  30.09 
 
 		 481 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  31.2 
 
 		 468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  32.34 
 
 		 472 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  32.91 
 
 		 449 aa  136  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  34.77 
 
 		 468 aa  136  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  30.12 
 
 		 450 aa  134  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  32.92 
 
 		 461 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  32.09 
 
 		 504 aa  133  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  28.87 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  34.46 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  28.12 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  29.43 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  25.85 
 
 		 472 aa  126  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  29.34 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  30.52 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  29.74 
 
 		 474 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  24.62 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.31 
 
 		 461 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  26.91 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  33.09 
 
 		 447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  30.12 
 
 		 450 aa  120  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  31.49 
 
 		 462 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  30.7 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.48 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7947  MmgE/PrpD family protein  30.53 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386701  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  29.17 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  26.05 
 
 		 481 aa  116  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  29.1 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  27.32 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>