209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0482 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  69.41 
 
 
463 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
457 aa  942    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  64.69 
 
 
456 aa  622  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  54.07 
 
 
455 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  52.2 
 
 
488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  51.26 
 
 
482 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  49.77 
 
 
483 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  50.93 
 
 
481 aa  438  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  42.76 
 
 
451 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  42.76 
 
 
451 aa  312  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  35.67 
 
 
471 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  35.87 
 
 
461 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  35 
 
 
451 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  31.07 
 
 
458 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  31.13 
 
 
490 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  33.1 
 
 
462 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  28.79 
 
 
451 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1327  MmgE/PrpD family protein  96.97 
 
 
102 aa  189  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.683901  hitchhiker  0.0000000000000530685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  31.86 
 
 
500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  30.75 
 
 
482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  29.37 
 
 
451 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  30.72 
 
 
450 aa  183  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  29.95 
 
 
453 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  30.41 
 
 
461 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  27.13 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  29.31 
 
 
462 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  27.87 
 
 
449 aa  172  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  27.73 
 
 
446 aa  171  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  31.05 
 
 
503 aa  171  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  27.66 
 
 
446 aa  170  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  30.37 
 
 
442 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  27.84 
 
 
451 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  30.27 
 
 
450 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  28.85 
 
 
443 aa  166  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  30.62 
 
 
503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  30.62 
 
 
503 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  30.7 
 
 
445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  33.56 
 
 
468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.4 
 
 
465 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  33.04 
 
 
456 aa  162  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  28.64 
 
 
468 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  27.29 
 
 
441 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  28.4 
 
 
456 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  27.33 
 
 
441 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  28.51 
 
 
476 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  30.59 
 
 
458 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  28.91 
 
 
456 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  29.78 
 
 
455 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  30.84 
 
 
454 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  29.33 
 
 
450 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  26.39 
 
 
449 aa  150  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  29.06 
 
 
457 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  28.83 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  29.72 
 
 
472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  27.84 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  27.58 
 
 
481 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  30.58 
 
 
458 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 
501 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  29.03 
 
 
453 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  30.97 
 
 
454 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  28 
 
 
450 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  26.93 
 
 
463 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  30.07 
 
 
458 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  28.94 
 
 
465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  29.29 
 
 
457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  31 
 
 
447 aa  141  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  32.86 
 
 
447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  32.5 
 
 
461 aa  140  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  30.53 
 
 
461 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  28.73 
 
 
459 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  30.3 
 
 
458 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  27.7 
 
 
453 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  27.86 
 
 
477 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  31.98 
 
 
454 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  28.2 
 
 
453 aa  137  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  28.07 
 
 
453 aa  136  8e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  32.95 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  24.47 
 
 
469 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  28.3 
 
 
453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  29 
 
 
457 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  28.04 
 
 
453 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  28.64 
 
 
470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  25.22 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  29.16 
 
 
486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  27.85 
 
 
462 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  29.57 
 
 
439 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  24.8 
 
 
449 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  25.24 
 
 
472 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  26.95 
 
 
449 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  25.83 
 
 
485 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  25.23 
 
 
457 aa  121  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  28.17 
 
 
470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  29.33 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  29.08 
 
 
461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  27.7 
 
 
454 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  23.91 
 
 
444 aa  118  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  29.43 
 
 
443 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  29.04 
 
 
454 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  24.18 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  25.83 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>