174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4802 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  78.65 
 
 		 461 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 476 aa  951    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  73.53 
 
 		 454 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  73.52 
 
 		 462 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  73.3 
 
 		 454 aa  606  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  69.93 
 
 		 454 aa  584  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  73.53 
 
 		 454 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  67.46 
 
 		 458 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  65.22 
 
 		 462 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  60.76 
 
 		 450 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  60.54 
 
 		 450 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  64.78 
 
 		 494 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  65.17 
 
 		 463 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  65.17 
 
 		 464 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  63.53 
 
 		 459 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  61.33 
 
 		 457 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  59.63 
 
 		 449 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  58.17 
 
 		 460 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  69.94 
 
 		 359 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  46.67 
 
 		 501 aa  423  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  38.7 
 
 		 451 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  33.41 
 
 		 449 aa  227  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  35.24 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  37.11 
 
 		 447 aa  206  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  36.09 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  35.01 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  34.28 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  33.49 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  33.99 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  33.62 
 
 		 454 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  35.02 
 
 		 458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  28.54 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  34.5 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  29.69 
 
 		 456 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  28.37 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  26.75 
 
 		 446 aa  170  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  33.55 
 
 		 458 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  32.38 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  31.85 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  34.47 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  28.09 
 
 		 446 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  35.45 
 
 		 458 aa  166  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  32.44 
 
 		 451 aa  166  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  33.55 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  32.37 
 
 		 456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  33.18 
 
 		 450 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  33.04 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  30.94 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  32.94 
 
 		 503 aa  156  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  30.63 
 
 		 481 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  35.31 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  34.56 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  29.72 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  32.48 
 
 		 453 aa  154  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  32.3 
 
 		 470 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  30.68 
 
 		 488 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  28.09 
 
 		 490 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  31.31 
 
 		 481 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  32.46 
 
 		 503 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  32.46 
 
 		 503 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  29.74 
 
 		 504 aa  150  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  28.04 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  29.5 
 
 		 485 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  30.12 
 
 		 481 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  34.46 
 
 		 461 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  27.12 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  30.17 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  30.52 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  31.26 
 
 		 461 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  30.95 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  27.71 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  30.06 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  30.96 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  32.71 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  30.34 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  31.73 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  32.7 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  30.07 
 
 		 476 aa  132  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  30.14 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  33.51 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  31.43 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  31.38 
 
 		 453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  24.02 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.78 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  29.56 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  25.6 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  29.98 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  32.02 
 
 		 453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  29.64 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  28.92 
 
 		 491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  30.44 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  28.92 
 
 		 491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  28.92 
 
 		 491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  32.3 
 
 		 468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  29.01 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  29.74 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  32.79 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  32.2 
 
 		 457 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  25.33 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  28.82 
 
 		 487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>