194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7947 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7947  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 463 aa  910    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  35.64 
 
 		 467 aa  190  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  37.77 
 
 		 441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  32.77 
 
 		 454 aa  140  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  30.4 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  30.25 
 
 		 450 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  28.74 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  29.43 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  30.3 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  32.13 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  26.7 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  29.59 
 
 		 455 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  27.01 
 
 		 501 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  27.66 
 
 		 451 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  27.61 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  30.57 
 
 		 449 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  31.05 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  33 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  29.21 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  26.78 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  28.37 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  30.81 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  32.77 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0572  MmgE/PrpD family protein  32.77 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  24.44 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  29.83 
 
 		 450 aa  101  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  28.54 
 
 		 486 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  30.16 
 
 		 461 aa  100  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.8 
 
 		 465 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  29.31 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  27.81 
 
 		 449 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  29.33 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  25.71 
 
 		 488 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  28.64 
 
 		 453 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  28.77 
 
 		 468 aa  97.8  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  30.5 
 
 		 443 aa  97.4  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  25.92 
 
 		 482 aa  97.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  30.6 
 
 		 456 aa  96.3  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  28.97 
 
 		 456 aa  96.3  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  27.83 
 
 		 454 aa  95.5  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.15 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  30.84 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  28.15 
 
 		 476 aa  93.6  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  32.22 
 
 		 468 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1088  MmgE/PrpD family protein  28.96 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  22.68 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  27.91 
 
 		 481 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  22.68 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  26.64 
 
 		 451 aa  90.1  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  28.75 
 
 		 458 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  24.76 
 
 		 450 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  29.87 
 
 		 463 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  29.87 
 
 		 464 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  23.4 
 
 		 449 aa  89  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  26.47 
 
 		 454 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  28.44 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  28.57 
 
 		 454 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  28.43 
 
 		 500 aa  88.2  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  28.34 
 
 		 454 aa  87.4  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  28.1 
 
 		 461 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  28.77 
 
 		 461 aa  86.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  26.59 
 
 		 456 aa  86.7  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  27.63 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  26.49 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2474  MmgE/PrpD family protein  30.28 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288716  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  23.62 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  27.71 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  29.16 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  27.81 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  29.37 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  27.92 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  26.83 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2695  MmgE/PrpD family protein  27.93 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  29.9 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  25.95 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  29.02 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  25.36 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  29.72 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  23.92 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  27.25 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  27.01 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  26.09 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  28.01 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  28.07 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  26.98 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  24.64 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  24.2 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  28.7 
 
 		 503 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  30.94 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  26.77 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  27.14 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  30.89 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  30.89 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  26.12 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  28.78 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  23.15 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  27.32 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  26.2 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  25.59 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>