160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2358 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  100 
 
 		 434 aa  868    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  53.18 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  50.46 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  47.04 
 
 		 456 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  41.09 
 
 		 450 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  32.63 
 
 		 467 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  31.78 
 
 		 441 aa  143  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  30.18 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  28.92 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  30.21 
 
 		 451 aa  119  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  27.68 
 
 		 451 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  30.46 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  26.8 
 
 		 453 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2474  MmgE/PrpD family protein  31.84 
 
 		 444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288716  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0572  MmgE/PrpD family protein  29.93 
 
 		 457 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1088  MmgE/PrpD family protein  27.62 
 
 		 472 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7496  MmgE/PrpD family protein  27.04 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000196116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  29.25 
 
 		 428 aa  103  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  27.85 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  29.77 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  29.09 
 
 		 470 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  29.19 
 
 		 468 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  27.05 
 
 		 481 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  28.63 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  26.73 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  24.48 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  28 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  29.79 
 
 		 443 aa  97.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  25.06 
 
 		 501 aa  97.1  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  29.15 
 
 		 503 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  30.03 
 
 		 463 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  30.03 
 
 		 464 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  25.18 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  27.32 
 
 		 458 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  26.71 
 
 		 487 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  25.57 
 
 		 469 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  26.27 
 
 		 457 aa  92.4  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  25.36 
 
 		 449 aa  92.8  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  29.07 
 
 		 503 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  29.07 
 
 		 503 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  27.52 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  28.31 
 
 		 464 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  29.74 
 
 		 471 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  31.37 
 
 		 451 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  26.13 
 
 		 456 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  28.49 
 
 		 447 aa  90.9  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  27.94 
 
 		 476 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  26.71 
 
 		 461 aa  90.1  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  27.46 
 
 		 457 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  22.78 
 
 		 446 aa  89.7  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  29.65 
 
 		 456 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  27.61 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  28.01 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  26.75 
 
 		 451 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  25.28 
 
 		 463 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  28.57 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  29.56 
 
 		 468 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  28.45 
 
 		 454 aa  86.3  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  22.78 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  27.38 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  29.67 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  26.81 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  27.47 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  26.04 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  30.22 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  28.57 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  27.03 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  28.15 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  29.28 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  26.97 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  26.29 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  26.29 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  33.89 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  26.29 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  28.64 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  26.07 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  24 
 
 		 460 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  25.35 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  29.93 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  28.98 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  30.21 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  23.88 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  25 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  24.12 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  27.1 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  24.72 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  25.7 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  26.09 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  27.51 
 
 		 489 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  26.35 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  23.6 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  26.35 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  26.35 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  26.35 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  27.19 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  26.76 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  23.66 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  27.07 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  29.36 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>