157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1088 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1088  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 472 aa  946    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  35.57 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  33.03 
 
 		 441 aa  156  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  29.13 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  27.39 
 
 		 501 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  30.63 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  25.95 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  29.35 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  28.57 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  28.85 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  25.33 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  26.58 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  28.24 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  26.92 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  29.89 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  27.48 
 
 		 476 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  27.86 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  25.69 
 
 		 456 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  26.63 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  26.68 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  26.77 
 
 		 503 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  24.06 
 
 		 450 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  27.13 
 
 		 454 aa  97.1  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  27.38 
 
 		 503 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  27.38 
 
 		 503 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  27.43 
 
 		 463 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  27.19 
 
 		 454 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  32.04 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  27.75 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  28.34 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  28.34 
 
 		 464 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  28.76 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  29.93 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  25.11 
 
 		 459 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  25.42 
 
 		 481 aa  91.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  28.07 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  29.11 
 
 		 468 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  25.27 
 
 		 468 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  29.27 
 
 		 458 aa  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  29.43 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.05 
 
 		 458 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  27.67 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  28.42 
 
 		 465 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  27.38 
 
 		 458 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  26.29 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  25.85 
 
 		 462 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  30.94 
 
 		 454 aa  87.4  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  25.42 
 
 		 451 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  27.65 
 
 		 500 aa  87.4  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  25.32 
 
 		 443 aa  86.7  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  25.19 
 
 		 453 aa  86.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  27.92 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  27.29 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  27.8 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  26.01 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  27.21 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  27.55 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  27.75 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  27.27 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  26.34 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  27.53 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7947  MmgE/PrpD family protein  28.78 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386701  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  27.38 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  24.76 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  27.58 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  25 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  26.59 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  25.88 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  25.88 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  25.88 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  26.81 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  26.72 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  24.61 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  26.81 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  25.83 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  23.97 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  25 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  25 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  31 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  25 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  25 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  26.82 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  23.89 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  24.31 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  28.38 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  24.51 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7308  MmgE/PrpD  28.18 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  24.51 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  23.49 
 
 		 460 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  23.91 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2695  MmgE/PrpD family protein  27.51 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2474  MmgE/PrpD family protein  28.85 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  30 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3409  MmgE/PrpD family protein  28.72 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  24.64 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  25.42 
 
 		 521 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  27.91 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  28.79 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  27.56 
 
 		 451 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  27.72 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>