247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1953 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 492 aa  990    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 492 aa  990    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  98.98 
 
 		 491 aa  978    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 492 aa  990    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  65.79 
 
 		 489 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  91.46 
 
 		 487 aa  881    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  98.98 
 
 		 491 aa  978    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  98.98 
 
 		 491 aa  977    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 492 aa  990    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  59.73 
 
 		 485 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  37.78 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 453 aa  272  1e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  36.65 
 
 		 453 aa  266  8e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  38.75 
 
 		 453 aa  257  4e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  33.04 
 
 		 428 aa  229  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  31.13 
 
 		 469 aa  226  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  31.07 
 
 		 435 aa  226  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  31.26 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2564  2-methylcitrate dehydratase  34.62 
 
 		 457 aa  204  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3495  2-methylcitrate dehydratase  33.41 
 
 		 502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  33.48 
 
 		 505 aa  176  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0042  2-methylcitrate dehydratase  32.94 
 
 		 502 aa  176  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0567  2-methylcitrate dehydratase  32.96 
 
 		 505 aa  176  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  29.15 
 
 		 471 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1525  2-methylcitrate dehydratase  32.02 
 
 		 506 aa  172  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828973 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11153  hypothetical protein  31.81 
 
 		 526 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1525  2-methylcitrate dehydratase  30.16 
 
 		 506 aa  170  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320923  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0107  2-methylcitrate dehydratase  32.99 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149416  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0620  2-methylcitrate dehydratase  31.86 
 
 		 499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12040  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.34 
 
 		 505 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0754559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2318  2-methylcitrate dehydratase  33.18 
 
 		 499 aa  167  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189904  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1348  2-methylcitrate dehydratase  33.15 
 
 		 507 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14140  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  30 
 
 		 508 aa  163  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3512  2-methylcitrate dehydratase  31.96 
 
 		 521 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2646  2-methylcitrate dehydratase  31.91 
 
 		 510 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  30.24 
 
 		 451 aa  160  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2656  2-methylcitrate dehydratase  32.1 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2512  MmgE/PrpD  31.8 
 
 		 507 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338768  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1656  2-methylcitrate dehydratase  31.97 
 
 		 499 aa  156  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1027  MmgE/PrpD family protein  25.44 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  25.06 
 
 		 521 aa  143  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  28.07 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  30.56 
 
 		 451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0655  2-methylcitrate dehydratase  30 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.781921  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0494  2-methylcitrate dehydratase  29.4 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1754  2-methylcitrate dehydratase  29.4 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.723906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0799  2-methylcitrate dehydratase  29.4 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  29.63 
 
 		 460 aa  128  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2477  2-methylcitrate dehydratase  29.4 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2339  2-methylcitrate dehydratase  29.4 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1824  2-methylcitrate dehydratase  29.4 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1616  2-methylcitrate dehydratase  29.4 
 
 		 502 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  28.6 
 
 		 500 aa  123  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0871  2-methylcitrate dehydratase  27.66 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000221374  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3306  2-methylcitrate dehydratase  28.2 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.494444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  26.29 
 
 		 453 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0651  2-methylcitrate dehydratase  29.28 
 
 		 485 aa  120  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  24.03 
 
 		 501 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3822  2-methylcitrate dehydratase  27.98 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  25.27 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  27.97 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4654  2-methylcitrate dehydratase  28.6 
 
 		 484 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0402  2-methylcitrate dehydratase  26.57 
 
 		 483 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000295232 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4353  2-methylcitrate dehydratase  25.21 
 
 		 483 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6862  2-methylcitrate dehydratase  26.33 
 
 		 483 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.195603  normal  0.185199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2157  2-methylcitrate dehydratase  27.33 
 
 		 483 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00288  2-methylcitrate dehydratase  26.37 
 
 		 483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2902  2-methylcitrate dehydratase  26.97 
 
 		 483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2002  2-methylcitrate dehydratase  27.93 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213723 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0358  2-methylcitrate dehydratase  26.16 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0422  2-methylcitrate dehydratase  26.21 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649578  normal  0.0549377 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  24.1 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0410  2-methylcitrate dehydratase  26.21 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282165 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2402  2-methylcitrate dehydratase  30.23 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.290074  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0399  2-methylcitrate dehydratase  26.16 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3272  2-methylcitrate dehydratase  26.16 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0464  2-methylcitrate dehydratase  26.35 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0004098  hitchhiker  0.00000887617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  28.6 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  27.41 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0404  2-methylcitrate dehydratase  26.21 
 
 		 483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  31.5 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0365  2-methylcitrate dehydratase  25.95 
 
 		 483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0405  2-methylcitrate dehydratase  25.95 
 
 		 483 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  28.92 
 
 		 461 aa  113  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3291  2-methylcitrate dehydratase  25.95 
 
 		 483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  27.41 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  24.1 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  24.44 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  25.36 
 
 		 481 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  26.61 
 
 		 472 aa  110  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  28.2 
 
 		 470 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  29.95 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1123  2-methylcitrate dehydratase  27.25 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  29.6 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2695  MmgE/PrpD family protein  28.69 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  22.02 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  25.84 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  26.11 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  31.68 
 
 		 456 aa  107  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  27.59 
 
 		 451 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>