244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1703 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  83.44 
 
 		 453 aa  776    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  85.43 
 
 		 453 aa  809    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 453 aa  932    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  50.34 
 
 		 457 aa  464  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  43.15 
 
 		 428 aa  364  2e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  42.89 
 
 		 435 aa  346  4e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  39.29 
 
 		 489 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  37.97 
 
 		 491 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  37.97 
 
 		 491 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  37.97 
 
 		 491 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  37.89 
 
 		 492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  37.89 
 
 		 492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  37.89 
 
 		 492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  37.89 
 
 		 492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  38.67 
 
 		 485 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  36.81 
 
 		 487 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  30.96 
 
 		 469 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  32.89 
 
 		 449 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0042  2-methylcitrate dehydratase  33.26 
 
 		 502 aa  203  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2564  2-methylcitrate dehydratase  33.26 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0567  2-methylcitrate dehydratase  33.99 
 
 		 505 aa  199  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  33.33 
 
 		 505 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14140  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  32.63 
 
 		 508 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2318  2-methylcitrate dehydratase  32.15 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189904  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12040  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.8 
 
 		 505 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0754559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1525  2-methylcitrate dehydratase  32.46 
 
 		 506 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1525  2-methylcitrate dehydratase  30.92 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3495  2-methylcitrate dehydratase  32.75 
 
 		 502 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3512  2-methylcitrate dehydratase  34.09 
 
 		 521 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  29.07 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0620  2-methylcitrate dehydratase  31.57 
 
 		 499 aa  186  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0107  2-methylcitrate dehydratase  32.66 
 
 		 505 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149416  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11153  hypothetical protein  29.84 
 
 		 526 aa  176  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2656  2-methylcitrate dehydratase  31.4 
 
 		 528 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2646  2-methylcitrate dehydratase  33.11 
 
 		 510 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1656  2-methylcitrate dehydratase  32.2 
 
 		 499 aa  170  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1348  2-methylcitrate dehydratase  30.35 
 
 		 507 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0799  2-methylcitrate dehydratase  29.4 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1123  2-methylcitrate dehydratase  28.63 
 
 		 481 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1032  2-methylcitrate dehydratase  29.4 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  30.16 
 
 		 476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1162  2-methylcitrate dehydratase  29.33 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.696099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2512  MmgE/PrpD  28.15 
 
 		 507 aa  147  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338768  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  25.33 
 
 		 456 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  28.07 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  26.33 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  25.11 
 
 		 521 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2207  2-methylcitrate dehydratase  29.8 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.50931  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  25.68 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  26.19 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0871  2-methylcitrate dehydratase  28.43 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000221374  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4353  2-methylcitrate dehydratase  29.3 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2601  2-methylcitrate dehydratase  30.48 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141042  decreased coverage  0.0000146252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1027  MmgE/PrpD family protein  26.23 
 
 		 458 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1939  2-methylcitrate dehydratase  28.18 
 
 		 494 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.73412  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0410  2-methylcitrate dehydratase  27.81 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1725  2-methylcitrate dehydratase  29.49 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0422  2-methylcitrate dehydratase  27.81 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649578  normal  0.0549377 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  25.73 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  29.98 
 
 		 472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3024  2-methylcitrate dehydratase  27.69 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0402  2-methylcitrate dehydratase  29.18 
 
 		 483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000295232 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3291  2-methylcitrate dehydratase  28.94 
 
 		 483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  27.85 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  26.14 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0404  2-methylcitrate dehydratase  27.61 
 
 		 483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2112  2-methylcitrate dehydratase  30.66 
 
 		 478 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00288  2-methylcitrate dehydratase  28.94 
 
 		 483 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0073  2-methylcitrate dehydratase  27.99 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3272  2-methylcitrate dehydratase  28.71 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0464  2-methylcitrate dehydratase  28.94 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0004098  hitchhiker  0.00000887617 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0365  2-methylcitrate dehydratase  28.71 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756913 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2451  2-methylcitrate dehydratase  30.66 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0986896  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2402  2-methylcitrate dehydratase  27.79 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.290074  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0358  2-methylcitrate dehydratase  28.71 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  27.87 
 
 		 481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  27.66 
 
 		 451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0399  2-methylcitrate dehydratase  28.71 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2338  2-methylcitrate dehydratase  27.86 
 
 		 494 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1302  2-methylcitrate dehydratase  30 
 
 		 500 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3432  2-methylcitrate dehydratase  27.49 
 
 		 494 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01192  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0405  2-methylcitrate dehydratase  28.47 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2902  2-methylcitrate dehydratase  28.66 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2377  2-methylcitrate dehydratase  30.42 
 
 		 478 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.470978  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1486  2-methylcitrate dehydratase  27.52 
 
 		 482 aa  127  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2316  2-methylcitrate dehydratase  30.42 
 
 		 478 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  25.88 
 
 		 455 aa  126  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2126  2-methylcitrate dehydratase  30.42 
 
 		 478 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3009  2-methylcitrate dehydratase  30.42 
 
 		 478 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.51966 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2368  2-methylcitrate dehydratase  30.42 
 
 		 478 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2157  2-methylcitrate dehydratase  29.95 
 
 		 478 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2002  2-methylcitrate dehydratase  28.05 
 
 		 488 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213723 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2189  2-methylcitrate dehydratase  31.18 
 
 		 478 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2349  2-methylcitrate dehydratase  31.18 
 
 		 478 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  26.44 
 
 		 488 aa  126  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1768  2-methylcitrate dehydratase  29.8 
 
 		 494 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0512259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1779  2-methylcitrate dehydratase  29.5 
 
 		 494 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293801  hitchhiker  0.00426686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0651  2-methylcitrate dehydratase  27.6 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6862  2-methylcitrate dehydratase  27.55 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.195603  normal  0.185199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1662  2-methylcitrate dehydratase  28.04 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>