248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2237 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  91.87 
 
 		 492 aa  890    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  92.46 
 
 		 491 aa  900    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  91.87 
 
 		 492 aa  890    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  66.19 
 
 		 489 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 487 aa  979    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  92.46 
 
 		 491 aa  900    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  92.46 
 
 		 491 aa  900    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  91.87 
 
 		 492 aa  890    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  91.87 
 
 		 492 aa  890    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  60.22 
 
 		 485 aa  542  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  37.25 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  37.25 
 
 		 453 aa  267  4e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 453 aa  266  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  38.18 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  32.12 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  31.25 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  33.03 
 
 		 428 aa  229  9e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2564  2-methylcitrate dehydratase  34.54 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258937  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  31.26 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3495  2-methylcitrate dehydratase  34.45 
 
 		 502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  33.79 
 
 		 505 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0567  2-methylcitrate dehydratase  33.26 
 
 		 505 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12040  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  32.12 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0754559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1525  2-methylcitrate dehydratase  32.12 
 
 		 506 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0107  2-methylcitrate dehydratase  34.18 
 
 		 505 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149416  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0042  2-methylcitrate dehydratase  32.73 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  28.91 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1348  2-methylcitrate dehydratase  32.07 
 
 		 507 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1525  2-methylcitrate dehydratase  31.55 
 
 		 506 aa  170  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320923  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14140  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  30.73 
 
 		 508 aa  169  9e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0620  2-methylcitrate dehydratase  32.66 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  30.59 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2318  2-methylcitrate dehydratase  33.68 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189904  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3512  2-methylcitrate dehydratase  32.41 
 
 		 521 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2656  2-methylcitrate dehydratase  31.67 
 
 		 528 aa  162  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11153  hypothetical protein  30.96 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2512  MmgE/PrpD  30.97 
 
 		 507 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2646  2-methylcitrate dehydratase  32.35 
 
 		 510 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1656  2-methylcitrate dehydratase  31.17 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0655  2-methylcitrate dehydratase  30.5 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.781921  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1754  2-methylcitrate dehydratase  29.94 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.723906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0799  2-methylcitrate dehydratase  29.94 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1824  2-methylcitrate dehydratase  29.94 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0494  2-methylcitrate dehydratase  29.94 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2339  2-methylcitrate dehydratase  29.94 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2477  2-methylcitrate dehydratase  29.94 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1616  2-methylcitrate dehydratase  29.94 
 
 		 502 aa  143  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1027  MmgE/PrpD family protein  26.11 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490086 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  27.68 
 
 		 460 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  25.32 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  30.05 
 
 		 460 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  31.08 
 
 		 451 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3306  2-methylcitrate dehydratase  29.11 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.494444 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  28.27 
 
 		 500 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0651  2-methylcitrate dehydratase  29.41 
 
 		 485 aa  130  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4353  2-methylcitrate dehydratase  27.22 
 
 		 483 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4654  2-methylcitrate dehydratase  29.26 
 
 		 484 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3822  2-methylcitrate dehydratase  28.48 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2157  2-methylcitrate dehydratase  28.27 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6862  2-methylcitrate dehydratase  26.27 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.195603  normal  0.185199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2902  2-methylcitrate dehydratase  26.69 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0871  2-methylcitrate dehydratase  27.43 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000221374  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  25.05 
 
 		 456 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  28.7 
 
 		 455 aa  123  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  26.67 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2002  2-methylcitrate dehydratase  28.43 
 
 		 488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  29.74 
 
 		 467 aa  119  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1123  2-methylcitrate dehydratase  28.99 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00288  2-methylcitrate dehydratase  26.77 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0402  2-methylcitrate dehydratase  26.75 
 
 		 483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000295232 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3599  2-methylcitrate dehydratase  28.48 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4438  2-methylcitrate dehydratase  28.48 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3929  2-methylcitrate dehydratase  28.48 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  24.33 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3272  2-methylcitrate dehydratase  26.55 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0410  2-methylcitrate dehydratase  26.54 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282165 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0399  2-methylcitrate dehydratase  26.58 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2402  2-methylcitrate dehydratase  28.35 
 
 		 470 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.290074  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0422  2-methylcitrate dehydratase  26.54 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649578  normal  0.0549377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0358  2-methylcitrate dehydratase  26.58 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0365  2-methylcitrate dehydratase  26.34 
 
 		 483 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0464  2-methylcitrate dehydratase  26.54 
 
 		 483 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0004098  hitchhiker  0.00000887617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0405  2-methylcitrate dehydratase  26.34 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0404  2-methylcitrate dehydratase  26.54 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  30.67 
 
 		 503 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  24.6 
 
 		 446 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3291  2-methylcitrate dehydratase  26.34 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  29.27 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  30.6 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1302  2-methylcitrate dehydratase  28.04 
 
 		 500 aa  115  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  24.38 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  26.29 
 
 		 481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1507  2-methylcitrate dehydratase  27.74 
 
 		 482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  30.07 
 
 		 503 aa  113  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  24.3 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  30.07 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  28.98 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  25.94 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  28.63 
 
 		 470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7308  MmgE/PrpD  28.17 
 
 		 504 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>