181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1027 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1027  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 458 aa  940    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  85.87 
 
 		 521 aa  805    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  25.84 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  29.72 
 
 		 485 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  27.86 
 
 		 489 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  25.88 
 
 		 491 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  25.88 
 
 		 491 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  25.88 
 
 		 491 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  27.25 
 
 		 492 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  27.25 
 
 		 492 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  27.25 
 
 		 492 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  27.25 
 
 		 492 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  26.11 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  27.78 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  25.44 
 
 		 471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  25.49 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  27.92 
 
 		 449 aa  126  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  23.67 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  24.03 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  23.21 
 
 		 469 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  26.6 
 
 		 472 aa  94.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1656  2-methylcitrate dehydratase  27.48 
 
 		 499 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2564  2-methylcitrate dehydratase  27.37 
 
 		 457 aa  90.1  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258937  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11153  hypothetical protein  24.31 
 
 		 526 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14140  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  23.7 
 
 		 508 aa  88.2  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  27.68 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  23.19 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  25.97 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1525  2-methylcitrate dehydratase  25.05 
 
 		 506 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320923  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  25 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  25.19 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1525  2-methylcitrate dehydratase  23.83 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3495  2-methylcitrate dehydratase  24.4 
 
 		 502 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12040  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  24.03 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0754559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2656  2-methylcitrate dehydratase  23.88 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0042  2-methylcitrate dehydratase  24.85 
 
 		 502 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  28.53 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  24.36 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2512  MmgE/PrpD  22.61 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338768  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2002  2-methylcitrate dehydratase  30.07 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  27.61 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0567  2-methylcitrate dehydratase  23.88 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2207  2-methylcitrate dehydratase  25.67 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.50931  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3512  2-methylcitrate dehydratase  24.93 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  26.67 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  25.95 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  28.26 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2318  2-methylcitrate dehydratase  24.05 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189904  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0655  2-methylcitrate dehydratase  28.97 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.781921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  28.01 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4353  2-methylcitrate dehydratase  27 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0107  2-methylcitrate dehydratase  25.42 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149416  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  23.64 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  23.64 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2646  2-methylcitrate dehydratase  22.56 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2902  2-methylcitrate dehydratase  25.27 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  25.11 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1616  2-methylcitrate dehydratase  28.28 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1754  2-methylcitrate dehydratase  28.14 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.723906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0799  2-methylcitrate dehydratase  28.14 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1348  2-methylcitrate dehydratase  22.28 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  25.41 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  22.32 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1824  2-methylcitrate dehydratase  28.14 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2477  2-methylcitrate dehydratase  28.14 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2339  2-methylcitrate dehydratase  28.14 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0494  2-methylcitrate dehydratase  28.14 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  23.91 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3306  2-methylcitrate dehydratase  26.42 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.494444 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  25.57 
 
 		 471 aa  67  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  25.97 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  25.38 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  22.26 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0620  2-methylcitrate dehydratase  22.79 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  26.98 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  25.7 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  24.14 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00288  2-methylcitrate dehydratase  25.98 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  22.78 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3291  2-methylcitrate dehydratase  25.98 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3272  2-methylcitrate dehydratase  25.98 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0358  2-methylcitrate dehydratase  25.98 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3822  2-methylcitrate dehydratase  25.6 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6862  2-methylcitrate dehydratase  24.6 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.195603  normal  0.185199 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0399  2-methylcitrate dehydratase  25.98 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  26.23 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2157  2-methylcitrate dehydratase  25.27 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  25.74 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0405  2-methylcitrate dehydratase  25.98 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0365  2-methylcitrate dehydratase  25.98 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  22.84 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  21.77 
 
 		 449 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4654  2-methylcitrate dehydratase  27.75 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  23.98 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  27.46 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  23.78 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0073  2-methylcitrate dehydratase  27.6 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  23.72 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  26.06 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>