205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6463 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 458 aa  897    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  96.94 
 
 		 458 aa  867    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  55.68 
 
 		 453 aa  455  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  54.81 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  53.81 
 
 		 486 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  35.2 
 
 		 451 aa  202  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  30.73 
 
 		 449 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  34.19 
 
 		 468 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  32.96 
 
 		 455 aa  176  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  31.32 
 
 		 456 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  29.4 
 
 		 446 aa  167  4e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  28.83 
 
 		 446 aa  167  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  28.38 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  32.58 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  32.58 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  32.78 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  37.67 
 
 		 442 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  33.18 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  32.59 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  32.82 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  34.85 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  35.07 
 
 		 464 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  32.43 
 
 		 483 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  29.32 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  37.78 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  37.22 
 
 		 443 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  32.53 
 
 		 470 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  33.85 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  33.64 
 
 		 460 aa  150  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  29.82 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  31.99 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  30.33 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  33.88 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  36.14 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  34.36 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  28.76 
 
 		 501 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  31.26 
 
 		 463 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  32.49 
 
 		 461 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  29.75 
 
 		 482 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  30.58 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  34.62 
 
 		 464 aa  146  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  29.61 
 
 		 460 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  34.94 
 
 		 453 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  31.51 
 
 		 454 aa  143  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  32.24 
 
 		 476 aa  143  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  34.77 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  30.84 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  33.03 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  33.73 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  33.88 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  33.88 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  32.2 
 
 		 451 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  34.38 
 
 		 456 aa  139  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  28.91 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  32.39 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.23 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  32 
 
 		 462 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  30.15 
 
 		 485 aa  136  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  31.72 
 
 		 454 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  33.55 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  31.8 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  30.25 
 
 		 490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  25.69 
 
 		 481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  29.44 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  30.99 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  32 
 
 		 494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  36.79 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  31.46 
 
 		 457 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  30.19 
 
 		 453 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  33.79 
 
 		 458 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  29.78 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  28.22 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  31.4 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  31.54 
 
 		 500 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  30.15 
 
 		 460 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  31.09 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  32.2 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  30.51 
 
 		 482 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  28.48 
 
 		 441 aa  122  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  32.07 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  31.58 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  30.94 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.26 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  25.86 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  31.95 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  29.18 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  31.07 
 
 		 461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  27.8 
 
 		 441 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  27.66 
 
 		 449 aa  117  6e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  33.61 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  26.28 
 
 		 472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  34.14 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  29.91 
 
 		 456 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  32.93 
 
 		 482 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  32.27 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  34.09 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  29.35 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  31.11 
 
 		 458 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  28.8 
 
 		 489 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>