186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1347 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 458 aa  903    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  60.86 
 
 		 454 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  60.75 
 
 		 457 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  60.81 
 
 		 458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  61.61 
 
 		 455 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  58.13 
 
 		 456 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  42.79 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  34.82 
 
 		 451 aa  236  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  36.1 
 
 		 450 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  39.29 
 
 		 463 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  39.29 
 
 		 464 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  34.88 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  33.61 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 456 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  41.29 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  35.75 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  30.02 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  35.46 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  37.97 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  36.38 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  36.77 
 
 		 503 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  34.98 
 
 		 470 aa  196  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  36.32 
 
 		 503 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  36.32 
 
 		 503 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  31.21 
 
 		 453 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  37.07 
 
 		 454 aa  193  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  35.03 
 
 		 458 aa  190  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  31.78 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  36.7 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  29.05 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  34.51 
 
 		 483 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  35.8 
 
 		 462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  33.65 
 
 		 488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  34.68 
 
 		 481 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  31.81 
 
 		 501 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  34.19 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  36.34 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  34.59 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  35.02 
 
 		 459 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  40.78 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  35.71 
 
 		 461 aa  178  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  41.21 
 
 		 494 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  28.67 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  34.16 
 
 		 481 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  30.07 
 
 		 457 aa  172  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  32.98 
 
 		 463 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  32.47 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  35.57 
 
 		 442 aa  170  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  34.6 
 
 		 482 aa  170  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  35.22 
 
 		 472 aa  170  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  32.56 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  34.46 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  34.23 
 
 		 476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  36.51 
 
 		 451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  40.65 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  34.56 
 
 		 453 aa  167  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  34.7 
 
 		 456 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  34.19 
 
 		 458 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  37.92 
 
 		 468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  34.68 
 
 		 461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  33.98 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  36.57 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  38.1 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  33.33 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  33.42 
 
 		 474 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  32.82 
 
 		 450 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  34.22 
 
 		 500 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  28.44 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  33.03 
 
 		 451 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  35.41 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  34.32 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  33.69 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  34.42 
 
 		 447 aa  156  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  32.13 
 
 		 458 aa  156  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  33.67 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  31.76 
 
 		 504 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  33.16 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  32.96 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  35.45 
 
 		 476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  32.42 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  36.14 
 
 		 359 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  31.2 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  31.58 
 
 		 463 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  30.72 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  35.17 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.04 
 
 		 465 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  30.84 
 
 		 450 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  29.95 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  31.86 
 
 		 486 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  29.4 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  41.95 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3409  MmgE/PrpD family protein  31.95 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  32.81 
 
 		 464 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  33.52 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  31.61 
 
 		 477 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  30.02 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  27.78 
 
 		 472 aa  128  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  27.69 
 
 		 485 aa  127  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>