161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8168 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  912    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  71.26 
 
 		 443 aa  601  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2474  MmgE/PrpD family protein  61.47 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288716  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  35.75 
 
 		 453 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7496  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 469 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000196116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0572  MmgE/PrpD family protein  36.24 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  31.24 
 
 		 441 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  27.82 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  26.96 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  26.96 
 
 		 451 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  27.15 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  32.78 
 
 		 461 aa  134  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  26.87 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  30.94 
 
 		 456 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  30.02 
 
 		 481 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  31.38 
 
 		 441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  27.15 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  29.92 
 
 		 454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  29.12 
 
 		 458 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  28.34 
 
 		 501 aa  119  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  29.9 
 
 		 434 aa  119  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  25.53 
 
 		 456 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  26.67 
 
 		 446 aa  119  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  29.11 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  29.04 
 
 		 456 aa  116  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  28.67 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  26.87 
 
 		 463 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  24.82 
 
 		 457 aa  113  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  29.03 
 
 		 457 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2695  MmgE/PrpD family protein  27.1 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  32.79 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  26.01 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  26.89 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  25.74 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7308  MmgE/PrpD  26.71 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.49 
 
 		 458 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  25.59 
 
 		 450 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  25.77 
 
 		 474 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  27.01 
 
 		 455 aa  106  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  27.9 
 
 		 504 aa  106  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  26.87 
 
 		 503 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2639  hypothetical protein  26.38 
 
 		 473 aa  106  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  26.87 
 
 		 503 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  28.77 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  27.81 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  24.83 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  26.81 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7947  MmgE/PrpD family protein  29.53 
 
 		 463 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  28.08 
 
 		 456 aa  103  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  28.85 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  26.47 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  28.77 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  25.12 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  28.32 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  26.93 
 
 		 470 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  27.81 
 
 		 453 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  26.65 
 
 		 503 aa  99.8  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  28.37 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  28.1 
 
 		 465 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  28.18 
 
 		 485 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  26.78 
 
 		 482 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  27.59 
 
 		 463 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  27.59 
 
 		 464 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  25.54 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  25.22 
 
 		 481 aa  97.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  27.62 
 
 		 460 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  31.46 
 
 		 458 aa  97.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  27.01 
 
 		 453 aa  97.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  27.03 
 
 		 468 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  28.02 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  26.9 
 
 		 458 aa  94  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  29.93 
 
 		 359 aa  94  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  28.92 
 
 		 461 aa  94  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  29.26 
 
 		 454 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  27.27 
 
 		 451 aa  91.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  24.11 
 
 		 449 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  28.57 
 
 		 462 aa  89.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  25.49 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  28.75 
 
 		 472 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  28.29 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  31.27 
 
 		 468 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  26.84 
 
 		 462 aa  87  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  29.25 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  26.33 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  27.32 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  27.53 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  27.07 
 
 		 488 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  27.01 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  31.95 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  26.68 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3409  MmgE/PrpD family protein  28.49 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  26.8 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  27.79 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  26.02 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  27.36 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  29.61 
 
 		 468 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  25.99 
 
 		 486 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  29.26 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  23.63 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>