160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8184 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 443 aa  899    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  71.26 
 
 		 451 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2474  MmgE/PrpD family protein  59.54 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288716  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  36.85 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7496  MmgE/PrpD family protein  31.86 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000196116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0572  MmgE/PrpD family protein  34.29 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  29.51 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  28.11 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  27.41 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  27.5 
 
 		 467 aa  130  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  30.92 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  33.25 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  26 
 
 		 446 aa  124  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  26.96 
 
 		 451 aa  123  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  26.22 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  29.12 
 
 		 450 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  30.11 
 
 		 441 aa  120  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  25.55 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  27.92 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  27.44 
 
 		 458 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  28.76 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  25.92 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  26.38 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  27.94 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  29.63 
 
 		 434 aa  110  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  26.94 
 
 		 474 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  29.66 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  28.84 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  26.74 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  30.43 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  28.14 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  28.57 
 
 		 456 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  26.33 
 
 		 463 aa  106  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  26.84 
 
 		 458 aa  106  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  24.32 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7308  MmgE/PrpD  28.27 
 
 		 504 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  25.9 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  26.78 
 
 		 470 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  28.21 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  26.23 
 
 		 504 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  25.35 
 
 		 482 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  26.54 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  28.87 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  26.05 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  27.61 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  25.17 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  27.97 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  26.83 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  28.7 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7947  MmgE/PrpD family protein  31.34 
 
 		 463 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  28.19 
 
 		 454 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  27.84 
 
 		 503 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  27.23 
 
 		 485 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  28.57 
 
 		 453 aa  97.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  25.97 
 
 		 469 aa  97.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  26.87 
 
 		 470 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  28.07 
 
 		 503 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  26.9 
 
 		 462 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  25.18 
 
 		 488 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  28.07 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  25.4 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  28.57 
 
 		 455 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  28.61 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  29.18 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  27.78 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  29.23 
 
 		 454 aa  90.9  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  27.75 
 
 		 465 aa  91.3  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  25.35 
 
 		 481 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 		 501 aa  90.1  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  25.73 
 
 		 481 aa  90.1  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  27.21 
 
 		 464 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  27.21 
 
 		 463 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  26.92 
 
 		 443 aa  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  28.67 
 
 		 476 aa  89.7  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2695  MmgE/PrpD family protein  25.11 
 
 		 469 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  24.31 
 
 		 483 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  28.63 
 
 		 472 aa  87.4  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  25.48 
 
 		 428 aa  87.4  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  26.01 
 
 		 486 aa  86.7  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2639  hypothetical protein  24.16 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  26.35 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  25.36 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  29.77 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  25.39 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  25.63 
 
 		 471 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  26.29 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  27.01 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  23.84 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  28.44 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  25.71 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  30.56 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  25.54 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1088  MmgE/PrpD family protein  24.83 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  26.18 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  24.78 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  35.38 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  25.3 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  29 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  23.64 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>