187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6206 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  93.99 
 
 		 451 aa  814    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 451 aa  902    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  42.76 
 
 		 457 aa  330  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  45.61 
 
 		 456 aa  322  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  41.26 
 
 		 455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  44.09 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  40.1 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  39.95 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  40.71 
 
 		 481 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  41.81 
 
 		 483 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  37.92 
 
 		 471 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  37.4 
 
 		 461 aa  236  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  32.02 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  35.68 
 
 		 451 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  34.73 
 
 		 503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  32.26 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  35.88 
 
 		 503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  35.88 
 
 		 503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  36.62 
 
 		 456 aa  167  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  30.24 
 
 		 490 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  27.37 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  29.37 
 
 		 449 aa  155  9e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  27.15 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  33.52 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  31.17 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  31.9 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  30.14 
 
 		 500 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  30 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  29.76 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  27.92 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  33.12 
 
 		 462 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  27.13 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  34.55 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  30.26 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  30.23 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  32.81 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  29.05 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.94 
 
 		 465 aa  137  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  29.72 
 
 		 461 aa  136  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  28.54 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  28.3 
 
 		 441 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  25.12 
 
 		 446 aa  133  5e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  27.96 
 
 		 468 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  31.26 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  30.37 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  31.33 
 
 		 472 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  30.05 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  31.53 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  28.13 
 
 		 463 aa  126  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  24.37 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  30.5 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  32.32 
 
 		 468 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  31.25 
 
 		 442 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  31.1 
 
 		 458 aa  123  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  31.71 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  28.91 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  28.47 
 
 		 482 aa  120  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  29.9 
 
 		 465 aa  119  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  28.31 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  29.17 
 
 		 450 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  29.19 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  30.68 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  29.49 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  30.29 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  28.24 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  29.1 
 
 		 457 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  25.06 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  29.53 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  31.77 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  25.52 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0288  putative MmgE/PrpD family protein  32.04 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  30 
 
 		 450 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  28.38 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  29.8 
 
 		 443 aa  106  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  28.12 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7945  MmgE/PrpD family protein  32.17 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762062  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  30.9 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  29.53 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  30.9 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  32.64 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  30.29 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  25.19 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3559  MmgE/PrpD family protein  30.4 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.595946  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  27.55 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  29.54 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  28.81 
 
 		 461 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  32.6 
 
 		 464 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  28.08 
 
 		 486 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  31.43 
 
 		 464 aa  97.1  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  21.65 
 
 		 444 aa  96.7  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  27.77 
 
 		 450 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  34.39 
 
 		 458 aa  96.3  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  30.37 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  31.14 
 
 		 456 aa  93.2  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  23.71 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  26.54 
 
 		 454 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0678  MmgE/PrpD family protein  30.95 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  29.29 
 
 		 454 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  28.54 
 
 		 454 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  29.89 
 
 		 494 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>