136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3559 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3559  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 442 aa  891    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.595946  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  90.72 
 
 		 442 aa  805    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  62.44 
 
 		 443 aa  537  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0678  MmgE/PrpD family protein  64.85 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  59.77 
 
 		 439 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  43.52 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  35.4 
 
 		 451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  37.28 
 
 		 500 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  33.81 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  39.06 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  33.59 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  35.25 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  40.14 
 
 		 454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  32.02 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  38.02 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  32.41 
 
 		 462 aa  133  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  35.15 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  37.41 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  29.19 
 
 		 453 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  33.43 
 
 		 456 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  30.19 
 
 		 490 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  33.42 
 
 		 441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  31.34 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  31.72 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  30.45 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  33.84 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  33.98 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  31.28 
 
 		 481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  30.54 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  32.37 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  28.05 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  34.53 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  30.4 
 
 		 451 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  30.52 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  28.88 
 
 		 482 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  30.82 
 
 		 501 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  31.77 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  30.33 
 
 		 488 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  28.53 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  32.17 
 
 		 450 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  32.74 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  26.76 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  32.06 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  30.63 
 
 		 450 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  33.15 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.47 
 
 		 461 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  33.67 
 
 		 454 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  30.63 
 
 		 450 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  28.49 
 
 		 456 aa  97.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  31.12 
 
 		 467 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  29.64 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  29.33 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.37 
 
 		 458 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  28.32 
 
 		 458 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  31.32 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  26.5 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  26 
 
 		 460 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  26.28 
 
 		 460 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  30.9 
 
 		 486 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  33.56 
 
 		 458 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  33.11 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  33.78 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  25.33 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  32.04 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  32.32 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  29.37 
 
 		 476 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  34.77 
 
 		 445 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  30.31 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2428  MmgE/PrpD  35.06 
 
 		 404 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0639632  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  28.12 
 
 		 481 aa  88.2  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  27.92 
 
 		 470 aa  87.4  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  31.48 
 
 		 461 aa  87.4  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  28.99 
 
 		 468 aa  87.4  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  27.27 
 
 		 470 aa  87  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  33.04 
 
 		 460 aa  86.3  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  24.58 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0288  putative MmgE/PrpD family protein  28.45 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  29.86 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  28.26 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  31.1 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  28.45 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  29.86 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  29.14 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  24 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  31.99 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  28.72 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  28.7 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  31.37 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  29.2 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  31.37 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  31.06 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  30.58 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  30.35 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  31.35 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  33.56 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  31 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  31.06 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  29.41 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  29.74 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  28.65 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>