173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0288 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0288  putative MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 456 aa  919    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  31.97 
 
 		 500 aa  146  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  31.65 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  37.65 
 
 		 462 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  33.42 
 
 		 462 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  29.71 
 
 		 458 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  32.1 
 
 		 453 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  34.14 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  29.25 
 
 		 457 aa  120  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  29.64 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  27.17 
 
 		 490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  28.8 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  27.42 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  27.23 
 
 		 449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  28.29 
 
 		 482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  29.32 
 
 		 463 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  29.76 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  29.12 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  28.09 
 
 		 482 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  28.11 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  29.8 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  26.29 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  27.25 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  28.36 
 
 		 453 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  28.15 
 
 		 456 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  27.73 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  28.57 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  29.7 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 454 aa  99.8  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  29.39 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  29.19 
 
 		 451 aa  97.8  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  30.34 
 
 		 451 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  32.25 
 
 		 465 aa  96.3  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  27.05 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  31.38 
 
 		 503 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  29.16 
 
 		 481 aa  92  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  28.37 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  29.62 
 
 		 451 aa  91.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  30.19 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  29.12 
 
 		 442 aa  90.1  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  27.54 
 
 		 481 aa  90.1  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  26.15 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  33.67 
 
 		 503 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  33.67 
 
 		 503 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  25.8 
 
 		 449 aa  87  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  29.88 
 
 		 464 aa  87  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  29.89 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  30.31 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3559  MmgE/PrpD family protein  29.67 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.595946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  28.32 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  30 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  26.02 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  27.2 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.31 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  27.96 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  28.74 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  28.4 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  30.11 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  27.05 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  26.17 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  25.74 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  28.43 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  29.19 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  25.74 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  25.74 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  29.41 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  26.53 
 
 		 487 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  25.18 
 
 		 501 aa  79.7  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  26.1 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  25.94 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  26.98 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  27.8 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  23.21 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  27.85 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  30.24 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  24.93 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  26.61 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  27.84 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  27.07 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  23.29 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  25.81 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  29.43 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  25.33 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  26.64 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  26.02 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  27.79 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  26.02 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  26.02 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  26.02 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  27.35 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  23.86 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  28.01 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  22.99 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  26.83 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  22.54 
 
 		 446 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  27.66 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  27.59 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2207  2-methylcitrate dehydratase  26.33 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.50931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  26.78 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0678  MmgE/PrpD family protein  31.47 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>