218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1051 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 449 aa  866    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  43.13 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  34.18 
 
 		 449 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  36.32 
 
 		 451 aa  203  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  34.35 
 
 		 450 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  33.74 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  34.1 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  33.14 
 
 		 501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  37.03 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  35.32 
 
 		 451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  32.7 
 
 		 454 aa  153  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  32.93 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  31.13 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  32.74 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  32.74 
 
 		 463 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  37.05 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  33.16 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  30.29 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  32.57 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  32.82 
 
 		 457 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  32.29 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  33.16 
 
 		 459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  30 
 
 		 456 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  30.3 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  35.13 
 
 		 503 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  31.14 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  35.13 
 
 		 503 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  31.73 
 
 		 494 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  34.09 
 
 		 458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  35.37 
 
 		 503 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  34.09 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  32.91 
 
 		 454 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  36.62 
 
 		 443 aa  136  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  27.98 
 
 		 446 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  31.12 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  36.94 
 
 		 468 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  35.73 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  31.61 
 
 		 488 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  27.38 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  35.59 
 
 		 477 aa  127  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  28.64 
 
 		 449 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  27.08 
 
 		 446 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  34.12 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  36.43 
 
 		 447 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  33.75 
 
 		 450 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  34.94 
 
 		 468 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  30.59 
 
 		 468 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  31.76 
 
 		 461 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  35.17 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  32.26 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  32.72 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  29.09 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  31.3 
 
 		 476 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  33.42 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  31.73 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  28.85 
 
 		 490 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  31.34 
 
 		 481 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  28.73 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  29.74 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  33.98 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  33.85 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  30.34 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  31.55 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  29.88 
 
 		 481 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  30.38 
 
 		 500 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  30.15 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  31.08 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  28.65 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  32.95 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  29.01 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  30 
 
 		 456 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  29.41 
 
 		 460 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  29.58 
 
 		 463 aa  106  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.92 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  30.49 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  29.5 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  31.43 
 
 		 482 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  31.21 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  31.54 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  34.23 
 
 		 462 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  32.46 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  33.73 
 
 		 482 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  31.47 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  31.53 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  29.32 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  31.25 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  29.93 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  30.48 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  33.72 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  27.75 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  34.86 
 
 		 471 aa  99  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  28.24 
 
 		 453 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  34.43 
 
 		 482 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 453 aa  96.7  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  29.03 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.72 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  30.72 
 
 		 470 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  26.76 
 
 		 472 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  27.34 
 
 		 504 aa  94.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  28.97 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>