137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7496 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7496  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 469 aa  966    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000196116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  39.69 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0572  MmgE/PrpD family protein  37.69 
 
 		 457 aa  243  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  33.26 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  31.86 
 
 		 443 aa  190  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2474  MmgE/PrpD family protein  30.02 
 
 		 444 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288716  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  26.39 
 
 		 453 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  27.57 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  26.13 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  26.09 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  25.22 
 
 		 450 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  26.82 
 
 		 441 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  28.32 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  27.51 
 
 		 454 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  26.14 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  26.64 
 
 		 458 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  27.92 
 
 		 467 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  23.33 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  25 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  23.35 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  27.69 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  27.65 
 
 		 456 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  27.61 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  28.91 
 
 		 453 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  24.51 
 
 		 446 aa  99  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  28.1 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  26.81 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2695  MmgE/PrpD family protein  28.41 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7308  MmgE/PrpD  27.11 
 
 		 504 aa  94  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  27.23 
 
 		 454 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  26.17 
 
 		 501 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  24.55 
 
 		 451 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  26.88 
 
 		 451 aa  90.1  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  27.46 
 
 		 454 aa  90.1  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  22.94 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  24.84 
 
 		 450 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  24.53 
 
 		 457 aa  87.8  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  27.71 
 
 		 460 aa  87.4  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  24.31 
 
 		 450 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2639  hypothetical protein  26.46 
 
 		 473 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  28.82 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  27.5 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  25.85 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  26.5 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  24.31 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  25.66 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  25 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  26.48 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  26.52 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  29.43 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  24.26 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  26.73 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  25.43 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  27.27 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  24.34 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  26.54 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  23.66 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  25.87 
 
 		 503 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  25.62 
 
 		 504 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  24.71 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  27.69 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  23.81 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  26.88 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  25.99 
 
 		 470 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  20.95 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  27.48 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  26.96 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  25.29 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  25.53 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  24.42 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  25.84 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  26.14 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  25.6 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  24.47 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  26.11 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  25.16 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  24.31 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  24.84 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  26.16 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  24.21 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  26.18 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  24.93 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  25.72 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  22.52 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  24.83 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  23.61 
 
 		 449 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  24.47 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  27.56 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  24.49 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  24.49 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  26.94 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  24.92 
 
 		 460 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  23.83 
 
 		 463 aa  66.6  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  27.96 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  24.04 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  23.01 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  25 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  25.88 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  22.72 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>