114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0923 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2338  2-methylcitrate dehydratase  76.72 
 
 		 494 aa  819    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1117  2-methylcitrate dehydratase  67.4 
 
 		 500 aa  711    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1768  2-methylcitrate dehydratase  80.77 
 
 		 494 aa  850    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0512259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1123  2-methylcitrate dehydratase  68.02 
 
 		 481 aa  699    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2419  2-methylcitrate dehydratase  79.55 
 
 		 494 aa  837    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00018845  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1302  2-methylcitrate dehydratase  68.21 
 
 		 500 aa  718    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54000  2-methylcitrate dehydratase  79.55 
 
 		 494 aa  845    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1572  2-methylcitrate dehydratase  64.17 
 
 		 481 aa  683    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1662  2-methylcitrate dehydratase  74.85 
 
 		 492 aa  798    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3432  2-methylcitrate dehydratase  76.92 
 
 		 494 aa  820    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01192  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0923  2-methylcitrate dehydratase  100 
 
 		 495 aa  1035    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.855648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4727  2-methylcitrate dehydratase  79.55 
 
 		 494 aa  846    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1725  2-methylcitrate dehydratase  61.95 
 
 		 478 aa  635    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1939  2-methylcitrate dehydratase  76.11 
 
 		 494 aa  807    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.73412  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1779  2-methylcitrate dehydratase  77.28 
 
 		 494 aa  818    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293801  hitchhiker  0.00426686 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4353  2-methylcitrate dehydratase  64.49 
 
 		 483 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1507  2-methylcitrate dehydratase  64.65 
 
 		 482 aa  655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2189  2-methylcitrate dehydratase  62.16 
 
 		 478 aa  631  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2126  2-methylcitrate dehydratase  62.37 
 
 		 478 aa  634  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2349  2-methylcitrate dehydratase  62.16 
 
 		 478 aa  631  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2368  2-methylcitrate dehydratase  62.37 
 
 		 478 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0073  2-methylcitrate dehydratase  61.26 
 
 		 481 aa  633  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2451  2-methylcitrate dehydratase  62.37 
 
 		 478 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0986896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2377  2-methylcitrate dehydratase  62.16 
 
 		 478 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.470978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2112  2-methylcitrate dehydratase  62.16 
 
 		 478 aa  630  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3009  2-methylcitrate dehydratase  62.16 
 
 		 478 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.51966 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0799  2-methylcitrate dehydratase  62.15 
 
 		 481 aa  631  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2157  2-methylcitrate dehydratase  62.16 
 
 		 478 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2316  2-methylcitrate dehydratase  61.95 
 
 		 478 aa  629  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2002  2-methylcitrate dehydratase  63.03 
 
 		 488 aa  627  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2902  2-methylcitrate dehydratase  63.47 
 
 		 483 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2402  2-methylcitrate dehydratase  61.54 
 
 		 470 aa  626  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.290074  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3272  2-methylcitrate dehydratase  61.37 
 
 		 483 aa  622  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0399  2-methylcitrate dehydratase  61.37 
 
 		 483 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0358  2-methylcitrate dehydratase  61.37 
 
 		 483 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6862  2-methylcitrate dehydratase  62.65 
 
 		 483 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.195603  normal  0.185199 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00288  2-methylcitrate dehydratase  61.17 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2157  2-methylcitrate dehydratase  62.86 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0655  2-methylcitrate dehydratase  62.45 
 
 		 483 aa  618  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.781921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2601  2-methylcitrate dehydratase  61.19 
 
 		 484 aa  620  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141042  decreased coverage  0.0000146252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3291  2-methylcitrate dehydratase  61.17 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0405  2-methylcitrate dehydratase  61.17 
 
 		 483 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3306  2-methylcitrate dehydratase  62.04 
 
 		 483 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.494444 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1162  2-methylcitrate dehydratase  59.67 
 
 		 474 aa  617  1e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.696099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0365  2-methylcitrate dehydratase  60.97 
 
 		 483 aa  617  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3822  2-methylcitrate dehydratase  62.15 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238522 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0410  2-methylcitrate dehydratase  60.98 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0464  2-methylcitrate dehydratase  61.22 
 
 		 483 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0004098  hitchhiker  0.00000887617 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0422  2-methylcitrate dehydratase  60.98 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649578  normal  0.0549377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0404  2-methylcitrate dehydratase  60.98 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0402  2-methylcitrate dehydratase  61.22 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000295232 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1486  2-methylcitrate dehydratase  60.53 
 
 		 482 aa  614  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1070  2-methylcitrate dehydratase  60.57 
 
 		 481 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.327536  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1497  2-methylcitrate dehydratase  60.32 
 
 		 482 aa  609  1e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4654  2-methylcitrate dehydratase  62.22 
 
 		 484 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1032  2-methylcitrate dehydratase  59.47 
 
 		 474 aa  611  1e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0799  2-methylcitrate dehydratase  61.54 
 
 		 483 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2339  2-methylcitrate dehydratase  61.54 
 
 		 483 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1754  2-methylcitrate dehydratase  61.34 
 
 		 483 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.723906  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4438  2-methylcitrate dehydratase  62.65 
 
 		 483 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3929  2-methylcitrate dehydratase  62.65 
 
 		 483 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1616  2-methylcitrate dehydratase  61.34 
 
 		 502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1824  2-methylcitrate dehydratase  61.34 
 
 		 483 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2477  2-methylcitrate dehydratase  61.13 
 
 		 483 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0494  2-methylcitrate dehydratase  61.34 
 
 		 483 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3599  2-methylcitrate dehydratase  62.65 
 
 		 483 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2207  2-methylcitrate dehydratase  57.81 
 
 		 483 aa  596  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.50931  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0871  2-methylcitrate dehydratase  61.32 
 
 		 483 aa  592  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000221374  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0651  2-methylcitrate dehydratase  57.99 
 
 		 485 aa  571  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3024  2-methylcitrate dehydratase  56.88 
 
 		 486 aa  561  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06639  2-methylcitrate dehydratase (Eurofung)  53.74 
 
 		 635 aa  518  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.738113  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47858  predicted protein  47.84 
 
 		 539 aa  473  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  29.92 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1525  2-methylcitrate dehydratase  27.14 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320923  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  26.88 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  26.64 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1656  2-methylcitrate dehydratase  26.43 
 
 		 499 aa  103  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  25.74 
 
 		 453 aa  103  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14140  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  28.44 
 
 		 508 aa  100  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3495  2-methylcitrate dehydratase  26.67 
 
 		 502 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1525  2-methylcitrate dehydratase  26.97 
 
 		 506 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0567  2-methylcitrate dehydratase  27.01 
 
 		 505 aa  94.7  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3512  2-methylcitrate dehydratase  27.17 
 
 		 521 aa  93.6  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12040  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  27.27 
 
 		 505 aa  92.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0754559  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1348  2-methylcitrate dehydratase  27.78 
 
 		 507 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  27.88 
 
 		 457 aa  91.7  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0107  2-methylcitrate dehydratase  28.26 
 
 		 505 aa  91.3  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149416  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  26.46 
 
 		 505 aa  90.1  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2646  2-methylcitrate dehydratase  26.84 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0042  2-methylcitrate dehydratase  26.61 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  24.26 
 
 		 485 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  24.63 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  27.14 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0620  2-methylcitrate dehydratase  26.46 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  23.54 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2318  2-methylcitrate dehydratase  26.34 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189904  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  23.54 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  23.54 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  23.54 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>