127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3574 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3574  iron dependent repressor  100 
 
 		 239 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.751623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4363  DtxR family iron dependent repressor  76.17 
 
 		 236 aa  340  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  41.43 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  39.52 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3304  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.98 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000325293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.55 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.23 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  29.9 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.49 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.79 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  30.1 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  28.57 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  28.7 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  27.91 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.69 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  27.91 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  31.76 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.14 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  29.9 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  28.75 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  30 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.17 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.36 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  29.67 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  36.05 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  31.71 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  28.8 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.46 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  25.65 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  26.63 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  37.36 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  37.36 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  37.36 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.96 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.12 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  31.91 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.03 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  33.01 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  33.01 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  33.01 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.88 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  31.34 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  26.25 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.72 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  28.93 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.57 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  30.53 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  29.88 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.95 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.92 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.46 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  29.34 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.34 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.63 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  33.33 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  27.54 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  29.53 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.29 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  37.78 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.62 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  34.38 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  29.77 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.35 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  30.47 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.97 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.41 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.73 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.37 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.51 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  30.53 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.89 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  36.26 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  30.43 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.9 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  28.74 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.61 
 
 		 234 aa  62  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.81 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  32.08 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.33 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  34.71 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  28.9 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.89 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.74 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.71 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  32.35 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.26 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  29.25 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.33 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  27.98 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  28 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  25.25 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  25.25 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.58 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  28 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  29.13 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>