More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5287 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5287  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 330 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.126425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1598  hypothetical protein  83.94 
 
 		 330 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  43.93 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  45.64 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  44.16 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  42.76 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  37.94 
 
 		 329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  36.05 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  37.61 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.77 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  38.68 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  35.71 
 
 		 332 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  36.39 
 
 		 336 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  38.13 
 
 		 337 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5655  hypothetical protein  36.7 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.315231  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  37.79 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  35.83 
 
 		 328 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  34.89 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  36.06 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  37.77 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.56 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  38.69 
 
 		 347 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  36.01 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  37.05 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  35.37 
 
 		 335 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  37.46 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.88 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.71 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4556  hypothetical protein  38.82 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.912833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  36.91 
 
 		 327 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.25 
 
 		 326 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  36.76 
 
 		 326 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.82 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.54 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  38.39 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2897  hypothetical protein  38.1 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0127604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  35.53 
 
 		 325 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  35.76 
 
 		 325 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  36.12 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  33.73 
 
 		 329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  36.79 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  36.22 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  35.4 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  35.76 
 
 		 333 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  35.71 
 
 		 358 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  36.62 
 
 		 334 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  35.43 
 
 		 325 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  35.67 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  36.72 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  37.22 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  35.92 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  36.28 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  39.68 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  35.03 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  34.34 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  36.13 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  32.89 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.42 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  39.08 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  36.34 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  34.73 
 
 		 328 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  34.59 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.58 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  35.46 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  34.13 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  35.03 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  33.02 
 
 		 339 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  35.6 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  34.41 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  36.22 
 
 		 344 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.16 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  35.55 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  35.79 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  36.27 
 
 		 322 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  34.12 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3049  hypothetical protein  35.93 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  34.3 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  35.45 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  36.31 
 
 		 366 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  37.34 
 
 		 340 aa  188  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  35.1 
 
 		 339 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  36.39 
 
 		 335 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  36.45 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  35.79 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  36.2 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.45 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  33.88 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  36.34 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  33.99 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  36.12 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  35.13 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  36.79 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  34.98 
 
 		 359 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  35.12 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  40.51 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  34.75 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  35.53 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.24 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>