More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5829 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5829  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0981  LysR family transcriptional regulator  64.13 
 
 		 324 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5680  LysR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 313 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.510006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3270  transcriptional regulator, LysR family  61.66 
 
 		 316 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0353308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3333  LysR family transcriptional regulator  58.68 
 
 		 314 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1313  LysR family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 311 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4577  LysR family transcriptional regulator  57.96 
 
 		 311 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1433  LysR family transcriptional regulator  57.96 
 
 		 311 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765945  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0951  LysR family transcriptional regulator  57.96 
 
 		 311 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1411  LysR family transcriptional regulator  57.96 
 
 		 311 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2535  transcription regulator protein  55.52 
 
 		 323 aa  349  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1352  LysR family transcriptional regulator  57.96 
 
 		 339 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1882  LysR family transcriptional regulator  57.32 
 
 		 311 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4811  LysR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 316 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3856  LysR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00676088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3823  LysR family transcriptional regulator  52.06 
 
 		 314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.696274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3523  LysR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 319 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0468645  normal  0.767514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3802  LysR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 331 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0872771  normal  0.681533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4548  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 352 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  37.79 
 
 		 335 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 298 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 309 aa  185  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 303 aa  185  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 296 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  34.31 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 296 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 296 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 305 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 328 aa  169  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3571  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368621  normal  0.292883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4684  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.62 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0686  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1128  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 293 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1233  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.573429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.3 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1113  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.800719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1434  LysR family substrate binding transcriptional regulator  32.24 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0593  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1984  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3222  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  35.22 
 
 		 293 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4938  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7013  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4262  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1482  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6347  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.264946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4186  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4357  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6421  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1185  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0305189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1542  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00182355  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3363  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5917  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 305 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5625  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5552  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 305 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5534  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2695  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2693  LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.426832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1186  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1256  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00128178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1330  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00626709  hitchhiker  0.000619665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3048  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0118588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1324  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.230209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3034  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 302 aa  159  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3191  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0504852  normal  0.2192 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5774  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 305 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  33.55 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2485  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.434999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4608  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.612778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48770  putative transcriptional regulator  32.34 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120965  hitchhiker  0.00000153166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>