More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3823 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3823  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  632  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.696274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0981  LysR family transcriptional regulator  57.91 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3270  transcriptional regulator, LysR family  57.23 
 
 		 316 aa  362  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0353308  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4811  LysR family transcriptional regulator  57.23 
 
 		 316 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5680  LysR family transcriptional regulator  53.05 
 
 		 313 aa  348  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.510006 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1433  LysR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 311 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765945  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0951  LysR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 311 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1411  LysR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 311 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4577  LysR family transcriptional regulator  57.74 
 
 		 311 aa  345  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1313  LysR family transcriptional regulator  57.74 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2535  transcription regulator protein  55.81 
 
 		 323 aa  342  5e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1352  LysR family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 339 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1882  LysR family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3333  LysR family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 314 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5829  LysR family transcriptional regulator  52.06 
 
 		 325 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3856  LysR family transcriptional regulator  51.27 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00676088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3523  LysR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0468645  normal  0.767514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4548  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 352 aa  271  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3802  LysR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 331 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0872771  normal  0.681533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 298 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  40.16 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1233  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.573429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1149  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.181713  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3094  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1652  LysR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 302 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3363  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1542  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00182355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1185  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0305189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 307 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 307 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3048  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0118588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3191  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0504852  normal  0.2192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1324  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.230209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1330  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00626709  hitchhiker  0.000619665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1186  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1256  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00128178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2868  transcriptional regulator, LysR family protein  33.33 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0376307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3034  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2695  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1128  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3459  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2693  LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.426832  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4162  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.711373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4777  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1224  carbonate dehydratase  32.27 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000421173  normal  0.31799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1113  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.800719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2676  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5286  transcriptional regulator, LysR family  39.44 
 
 		 302 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 304 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 304 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1615  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86393  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0188  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3456  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.695325 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4063  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3963  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31630  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.469253  normal  0.129426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4303  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2690  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 300 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.11 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2485  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.434999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>