More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4877 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4877  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  471  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00405478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  61.27 
 
 		 367 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  41.73 
 
 		 355 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  41.5 
 
 		 379 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01789  porin protein  43.26 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  37.25 
 
 		 402 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  41.84 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  41.13 
 
 		 355 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  41.13 
 
 		 355 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  38.85 
 
 		 355 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  40.76 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  37.11 
 
 		 386 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  37.11 
 
 		 386 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  40.14 
 
 		 353 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  38.85 
 
 		 374 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  36.18 
 
 		 401 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  36.49 
 
 		 358 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  33.81 
 
 		 352 aa  95.5  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  36.6 
 
 		 371 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  37.66 
 
 		 379 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  36.17 
 
 		 356 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  34.62 
 
 		 383 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  34.62 
 
 		 383 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  34.62 
 
 		 383 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  35.95 
 
 		 362 aa  88.2  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  33.54 
 
 		 383 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  33.97 
 
 		 383 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  34.84 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  35.33 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  34.84 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  33.83 
 
 		 352 aa  79  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  32.14 
 
 		 393 aa  79  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2990  porin  34.18 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0177619  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  32.28 
 
 		 387 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3860  putative outer membrane porin signal peptide protein  33.75 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.087708  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5504  outer membrane porin  33.33 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  35.04 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  30.82 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  30.3 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  31.9 
 
 		 392 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  31.9 
 
 		 392 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3144  porin  29.94 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  41.9 
 
 		 389 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  29.53 
 
 		 367 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  28.67 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  28.67 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  28.8 
 
 		 363 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5288  outer membrane porin  31.68 
 
 		 386 aa  65.5  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  46.67 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  42.86 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  29.58 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  30.57 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  31.39 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  33.33 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  38.83 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  27 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.88 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  41.94 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  37.5 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.78 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  27.03 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  29.11 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  39.78 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.78 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.78 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.78 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.78 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  39.78 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  29.22 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  44.19 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  44.19 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  40.48 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4171  porin  31.51 
 
 		 381 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315389  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  40.96 
 
 		 384 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  40.96 
 
 		 384 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  40.96 
 
 		 384 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  40.96 
 
 		 384 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0032  porin  45.24 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  29.22 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5712  porin  29.71 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  39.29 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2538  porin  28.48 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.47604 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  38.1 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  35.56 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  38.1 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  41.67 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  37.31 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  39.76 
 
 		 384 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  37.23 
 
 		 400 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  29.23 
 
 		 363 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  37.31 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  39.29 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  27.74 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  39.29 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  39.76 
 
 		 384 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  37.31 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  39.29 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  37.31 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  39.29 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  39.76 
 
 		 384 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>