More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0794 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0794  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 393 aa  777    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.576117  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2451  LysR family transcriptional regulator  99.06 
 
 		 318 aa  624  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0441198 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0385  LysR family transcriptional regulator  84.79 
 
 		 334 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5246  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.64 
 
 		 311 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2052  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 300 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3716  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 290 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.294124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2203  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 299 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2874  transcriptional regulator, LysR family  27.38 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0871  transcriptional regulator, LysR family  27.38 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2894  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal  0.204254 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2590  transcriptional regulator, LysR family  27.38 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0795  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0791  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0822  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.835428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2728  transcriptional regulator CatR  30.92 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1678  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08760  Transcriptional regulator, LysR family  31.87 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.139187  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2334  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0654  regulatory protein, LysR  36.84 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0831  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0434505  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  26.57 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  30.52 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0321  transcriptional regulator LysR family  36.18 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.916325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  29.45 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0011  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0559  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0351204  normal  0.326115 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.43 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.43 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.43 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  28.43 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  28.52 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  28.52 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  28.29 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.43 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.43 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5106  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000185857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.43 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.43 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1975  transcriptional regulator, LysR family  32.91 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.76 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0119  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.76 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.985596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  28.79 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4079  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.76 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3810  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  29.03 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.77 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  29.03 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4876  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0982311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  29.03 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.97 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  29.03 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  29.03 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.67 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1367  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.67 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3479  transcriptional regulator, LysR family  26.76 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.71 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5056  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0449  transcriptional regulator, LysR family  30.81 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2018  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132801  normal  0.140237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  29.76 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.64 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.64 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0541  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.693212  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3739  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1190  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.85 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00909  transcriptional regulator LysR family  36.05 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0474149  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 297 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2061  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2959  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3827  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.645077  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>