More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0085 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1674  multi-sensor hybrid histidine kinase  80.13 
 
 		 890 aa  1377    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00434081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1721  multi-sensor hybrid histidine kinase  99.77 
 
 		 869 aa  1738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 888 aa  1778    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.408662  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0962  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 		 823 aa  361  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1567  sensory transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 855 aa  325  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0218  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 855 aa  318  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.227193  normal  0.9118 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3048  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 		 850 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 1350 aa  261  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 846 aa  242  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 767 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 738 aa  240  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 674 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 631 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  37.9 
 
 		 900 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 1226 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.94 
 
 		 863 aa  234  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 		 866 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  30.83 
 
 		 784 aa  233  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1059 aa  232  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 		 896 aa  228  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 		 947 aa  228  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 1069 aa  227  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 903 aa  226  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.24 
 
 		 763 aa  226  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.72 
 
 		 982 aa  225  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 		 1158 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 902 aa  223  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 874 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 1596 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 827 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 756 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 873 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 633 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 803 aa  221  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 1124 aa  221  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 850 aa  221  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  30.33 
 
 		 1560 aa  220  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 		 643 aa  220  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 1075 aa  219  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 881 aa  219  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 1222 aa  219  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 		 882 aa  218  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  31.94 
 
 		 755 aa  217  8e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 940 aa  217  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 939 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  29.15 
 
 		 1119 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 643 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 643 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 873 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 781 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 724 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 		 643 aa  214  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.04 
 
 		 823 aa  213  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 		 1055 aa  213  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 1078 aa  213  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 1068 aa  213  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.54 
 
 		 772 aa  213  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1127 aa  212  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 1199 aa  213  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  32.42 
 
 		 781 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 765 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  35.84 
 
 		 651 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 932 aa  211  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 1223 aa  211  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 718 aa  210  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1068 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 907 aa  209  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  36.88 
 
 		 544 aa  209  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 		 687 aa  209  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  36.01 
 
 		 651 aa  208  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65860  putative two-component sensor  34.01 
 
 		 770 aa  208  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 		 846 aa  208  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 859 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1704  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.14 
 
 		 1168 aa  207  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 		 1271 aa  207  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.71 
 
 		 645 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 		 1287 aa  206  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5715  putative two-component sensor  34.42 
 
 		 750 aa  207  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.901003  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 1005 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 870 aa  206  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  33.25 
 
 		 882 aa  206  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 785 aa  206  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  37.32 
 
 		 606 aa  206  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.46 
 
 		 1204 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0206  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 771 aa  206  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 1116 aa  205  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 		 1049 aa  205  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  33.64 
 
 		 1060 aa  204  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 		 862 aa  204  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 		 924 aa  204  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 969 aa  203  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 973 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 524 aa  203  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 		 1313 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 695 aa  203  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 627 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 911 aa  203  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  35.82 
 
 		 641 aa  202  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 877 aa  202  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1131 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>