190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3290 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  95.45 
 
 		 198 aa  361  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  66.33 
 
 		 198 aa  256  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  66.84 
 
 		 199 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  55.05 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  49.48 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  44.39 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  39.69 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  34.9 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  36.84 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  35.03 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  33.16 
 
 		 208 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  31.96 
 
 		 221 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  31.96 
 
 		 221 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  35.68 
 
 		 460 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  31.96 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  32.47 
 
 		 220 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  31.96 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  33.16 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  33.16 
 
 		 259 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  33.16 
 
 		 259 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  32.99 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  32.47 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  29.9 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  29.69 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  29.17 
 
 		 261 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  30.53 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  30.53 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  30.53 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  30.53 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  30.53 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  30.53 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  29.17 
 
 		 218 aa  98.2  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  34.74 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  32.92 
 
 		 229 aa  95.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  32.64 
 
 		 449 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  28.95 
 
 		 245 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  35.39 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  35.88 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  30.46 
 
 		 462 aa  88.2  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  34.27 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  31.64 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  29.31 
 
 		 406 aa  84.7  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  33.51 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  30.58 
 
 		 434 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  30.1 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  33.72 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  30.39 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  34.41 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  35.48 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  32.47 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  30.46 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  34.2 
 
 		 423 aa  75.5  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  29.08 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  25.61 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  29.08 
 
 		 429 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  31.29 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  34.09 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  29.32 
 
 		 449 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  27.51 
 
 		 450 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  26.98 
 
 		 415 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  28.1 
 
 		 423 aa  67.8  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1717  paraquat-inducible protein A  28.86 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000226813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1467  PqiA family integral membrane protein  26.98 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00123019  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1991  integral membrane protein, PqiA family  26.98 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.227718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2049  hypothetical protein  26.98 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  29.21 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1283  integral membrane protein, PqiA family  26.98 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000216228  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1580  paraquat-inducible protein A  28.81 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.230902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1987  integral membrane protein PqiA family  26.98 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  hitchhiker  0.00476807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  26.94 
 
 		 413 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1797  paraquat-inducible protein A  27.07 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0702887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1930  paraquat-inducible protein A  29.44 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134385  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  26.2 
 
 		 426 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1842  integral membrane protein, PqiA family  27.75 
 
 		 454 aa  64.7  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  25.51 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  24.37 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  24.62 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  24.37 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  28.29 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  28.29 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  24.37 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  24.75 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  24.37 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  25.4 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  24.37 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  29.14 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  27.72 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  29.29 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  28.28 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  29.27 
 
 		 464 aa  62.4  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  28.28 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  25.89 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  26.4 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  28.65 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2233  paraquat-inducible protein A  29.55 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.80452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  25.52 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2077  integral membrane protein, PqiA family  28.22 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  27.27 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>