210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0707 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 261 aa  520  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  91.81 
 
 		 251 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  78 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  66.02 
 
 		 221 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  67.74 
 
 		 218 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  66.82 
 
 		 218 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  66.82 
 
 		 218 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  66.82 
 
 		 218 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  66.82 
 
 		 218 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  66.82 
 
 		 218 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  66.82 
 
 		 218 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  63.03 
 
 		 221 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  64.36 
 
 		 221 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  64.36 
 
 		 221 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  63.86 
 
 		 220 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  63.86 
 
 		 220 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  65.35 
 
 		 221 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  52.82 
 
 		 449 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  52.94 
 
 		 460 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  45.79 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  40.85 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  47.62 
 
 		 462 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  43.35 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  44.06 
 
 		 209 aa  158  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  45.26 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  43.67 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  38.58 
 
 		 208 aa  142  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  37 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  38.34 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  38.34 
 
 		 259 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  46.84 
 
 		 204 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  34.2 
 
 		 198 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  33.99 
 
 		 215 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  33.67 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  39.9 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  46.2 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  33.01 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  38.94 
 
 		 423 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  36.98 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  37.82 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  36.46 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  37.37 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  34.72 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  33.85 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  33.33 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  36.08 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  35.75 
 
 		 219 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  30.1 
 
 		 405 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  31.68 
 
 		 208 aa  99.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  31.09 
 
 		 198 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  27.78 
 
 		 464 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  29.36 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  29.17 
 
 		 198 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  31.16 
 
 		 212 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  29.67 
 
 		 402 aa  95.5  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  27.68 
 
 		 406 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  29.17 
 
 		 198 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  32.4 
 
 		 205 aa  93.6  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  28.86 
 
 		 434 aa  93.2  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  30.99 
 
 		 444 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  32.02 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 216 aa  89.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  30.43 
 
 		 212 aa  89  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  29.65 
 
 		 423 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  25.85 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  25.82 
 
 		 224 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  30.65 
 
 		 213 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  31.41 
 
 		 413 aa  86.3  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  30 
 
 		 206 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  30.57 
 
 		 207 aa  85.1  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  30.21 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  28.35 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  29.29 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  29.17 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  30 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  31.82 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  28.5 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  30.41 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  25.37 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  30 
 
 		 206 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  30.69 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  28.87 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  27.98 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  25.63 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  27.98 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  28.5 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  28.04 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  23.66 
 
 		 426 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  29.07 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  29.55 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  26.8 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  27.57 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2232  paraquat-inducible protein A  23.9 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  26.11 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  25.6 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  25.6 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  26.6 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>