210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0581 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  80.86 
 
 		 223 aa  346  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  50.49 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  47.55 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  44.08 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  42.36 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  46.56 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  44.29 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  46.56 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  44.76 
 
 		 220 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  43.96 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  40.85 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  43.54 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  44.78 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  44.44 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  44.44 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  44.44 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  44.44 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  44.44 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  44.44 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  44.16 
 
 		 245 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  43 
 
 		 449 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  39.46 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  41.26 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  41.62 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  38.2 
 
 		 259 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  36.95 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  39.58 
 
 		 460 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  39.88 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  41.35 
 
 		 449 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  40.3 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  47.42 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  47.7 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  44.85 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  36.87 
 
 		 462 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  39.13 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  35.38 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  39.71 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  34.9 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  34.02 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  33 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  35.85 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  42.93 
 
 		 423 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  32.66 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  35.03 
 
 		 199 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  37.44 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  30.19 
 
 		 434 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  36.49 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  30.29 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  34.02 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  35.35 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  36.45 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  36.14 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  34.84 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  31.13 
 
 		 444 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  31.34 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  32.34 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  30.66 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  32.5 
 
 		 464 aa  96.3  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  29.38 
 
 		 413 aa  92.8  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  28.12 
 
 		 419 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  30.88 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  27.62 
 
 		 423 aa  90.1  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  30.1 
 
 		 252 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  26.6 
 
 		 406 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  30.86 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  29.44 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  29.39 
 
 		 489 aa  85.9  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  29.7 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  30.05 
 
 		 206 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  28.08 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  28.37 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  30.95 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  27.72 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  28.06 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  29.23 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  24.73 
 
 		 402 aa  82  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  29.17 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2233  paraquat-inducible protein A  29.79 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.80452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  29.06 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  27.84 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  28.71 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  28.02 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  24.51 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  26.5 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  26.73 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2207  paraquat-inducible protein A  29.55 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  26.29 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  29.73 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  26.8 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  28.85 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  28.85 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  24.39 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  30.14 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  26.24 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2565  paraquat-inducible protein A  29.33 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.56837  normal  0.166721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1569  paraquat-inducible protein A  30.98 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.70952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  29.33 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2445  paraquat-inducible protein A  29.33 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00132645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>