208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3244 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 209 aa  418  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  57.42 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  54.12 
 
 		 221 aa  205  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  42.36 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  55.48 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  45.88 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  45.88 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  42.65 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  45.88 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  44.85 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  45 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  44.33 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  44.33 
 
 		 220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  49.25 
 
 		 204 aa  160  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  42.64 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  44.16 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  40.89 
 
 		 261 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  42.44 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  44.72 
 
 		 449 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  40.98 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  40.98 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  40.98 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  40.98 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  40.98 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  40.98 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  49.74 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  41.87 
 
 		 423 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  41.45 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  41.27 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  41 
 
 		 449 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  37.02 
 
 		 212 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  36.76 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  36.6 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  38.07 
 
 		 460 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  36.73 
 
 		 292 aa  121  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  36.13 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  40.2 
 
 		 462 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  34.2 
 
 		 198 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  34.54 
 
 		 259 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  32.52 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  34.02 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  32.32 
 
 		 198 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  32.31 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  34.31 
 
 		 219 aa  101  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  32.23 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  34.65 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  32.51 
 
 		 219 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  30.33 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  36.41 
 
 		 219 aa  97.8  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  31.79 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  31.79 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  28.24 
 
 		 434 aa  92.8  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  32.16 
 
 		 413 aa  91.7  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  29.84 
 
 		 406 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  32.11 
 
 		 444 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  28.86 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  31.03 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  27.45 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  27.14 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  32.11 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  28.08 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  28.28 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  26.96 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  29.65 
 
 		 464 aa  88.2  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  26.6 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2232  paraquat-inducible protein A  28.36 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  30.29 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  29.74 
 
 		 489 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  28.64 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  30.62 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  31.88 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  25.62 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  27.46 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  31.91 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  28.64 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  29.35 
 
 		 414 aa  81.6  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  29.23 
 
 		 448 aa  81.3  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  29.15 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2129  paraquat-inducible protein A  28.72 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00475203  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  28.64 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  29.74 
 
 		 415 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  28.65 
 
 		 426 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  29.74 
 
 		 415 aa  78.2  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  28.23 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  27.81 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  28.65 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  25.93 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  25.88 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1581  paraquat-inducible protein A  30.85 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  31.31 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  26.34 
 
 		 405 aa  75.9  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  26.04 
 
 		 380 aa  75.9  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  29.44 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  34.62 
 
 		 417 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2487  paraquat-inducible protein A  29.7 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00109447  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  27.45 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  26.01 
 
 		 426 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  34.62 
 
 		 417 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>