208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1798 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2129  paraquat-inducible protein A  68.75 
 
 		 208 aa  323  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00475203  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2206  paraquat-inducible protein A  71.01 
 
 		 210 aa  322  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1900  Paraquat-inducible protein A  70.05 
 
 		 210 aa  314  7e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00104452  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2564  paraquat-inducible protein A  70.05 
 
 		 210 aa  314  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.794352  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2444  paraquat-inducible protein A  70.05 
 
 		 210 aa  314  7e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0158328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2451  paraquat-inducible protein A  70.05 
 
 		 210 aa  314  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.356157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2487  paraquat-inducible protein A  71.63 
 
 		 208 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00109447  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1581  paraquat-inducible protein A  66.67 
 
 		 215 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1669  paraquat-inducible protein A  71.84 
 
 		 211 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1744  paraquat-inducible protein A  72.33 
 
 		 211 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.457122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1774  paraquat-inducible protein A  72.33 
 
 		 211 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233291  normal  0.160696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2232  paraquat-inducible protein A  65 
 
 		 208 aa  295  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  64.42 
 
 		 209 aa  293  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1718  paraquat-inducible protein A  66.16 
 
 		 209 aa  249  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2604.1  hypothetical protein  73.08 
 
 		 161 aa  214  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  31.16 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  31.16 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  29.56 
 
 		 416 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  29.72 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  32.93 
 
 		 419 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  30 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2221  paraquat-inducible protein A  34.72 
 
 		 198 aa  94  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00681473  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  30.15 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  29.06 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  28.43 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  29.15 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  26.29 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  29.7 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  28.89 
 
 		 408 aa  85.1  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  25.78 
 
 		 414 aa  85.1  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  24.63 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  32.26 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  26.5 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  25.76 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  26.97 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  26.63 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  26.97 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  26.97 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  25.79 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  27.78 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  24.27 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  26.26 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  26.26 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  26.26 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  26.26 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  26 
 
 		 417 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  27.83 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  26.42 
 
 		 422 aa  79  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  25.89 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  29.21 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  29.21 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  24.41 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  26.82 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  28.71 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  26.11 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  27.91 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  24.14 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  28.43 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  26.7 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  26.7 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  26.7 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  28.22 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  26.7 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  26.7 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  26.7 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  26.7 
 
 		 417 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  28.22 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  28.22 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  26.7 
 
 		 417 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  26.7 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  24.37 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  25.38 
 
 		 444 aa  75.5  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  25.5 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  27.17 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  26.05 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  26.14 
 
 		 423 aa  75.1  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  29.8 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  24.88 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  26.01 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  24.76 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  26.4 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  22.17 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  25 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  25.73 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  23.38 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  23.81 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  23.81 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  24.51 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  22.22 
 
 		 458 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  25.12 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  24.27 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  23.15 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  24 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  24 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  24.37 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2581  paraquat-inducible protein A  25.84 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  22 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  27.49 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  22.84 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>