212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1013 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 219 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  78.54 
 
 		 219 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  78.08 
 
 		 219 aa  340  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  78.9 
 
 		 219 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  76.26 
 
 		 219 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  70.51 
 
 		 218 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  70.51 
 
 		 235 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  73.85 
 
 		 219 aa  308  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  36.32 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  36.95 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  35.32 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  36.5 
 
 		 208 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  36.36 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  37.31 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  35.5 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  34.85 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  35.75 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  35.75 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  36.89 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  35.92 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  36.41 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  35.18 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  33.63 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  35.92 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  35.92 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  35.5 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  34.27 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  35.29 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  33.17 
 
 		 423 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  35.5 
 
 		 221 aa  118  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  34.12 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  35.38 
 
 		 220 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2206  paraquat-inducible protein A  32.18 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  36.07 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  33.49 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  30 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  35.38 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  33.5 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  32.7 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  38.27 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2564  paraquat-inducible protein A  31.19 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.794352  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2444  paraquat-inducible protein A  31.19 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0158328  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  35.78 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1900  Paraquat-inducible protein A  31.19 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00104452  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2451  paraquat-inducible protein A  31.19 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.356157  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2129  paraquat-inducible protein A  33.67 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00475203  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  35.03 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  30.84 
 
 		 449 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  30.14 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  36.22 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  29.38 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1669  paraquat-inducible protein A  31.19 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  31 
 
 		 224 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1744  paraquat-inducible protein A  31.19 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.457122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  36.22 
 
 		 460 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  33.5 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  29.23 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  32.23 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1774  paraquat-inducible protein A  31.16 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233291  normal  0.160696 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  35.27 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  28.79 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  36.42 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  35.8 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  35.8 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  35.8 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  35.8 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  35.8 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  35.8 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  32.65 
 
 		 464 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  33 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  33 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  30.85 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  30.61 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  34.13 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  33.17 
 
 		 449 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  33 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  33 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  29.67 
 
 		 444 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  32.56 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  32.56 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  32.56 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  28.64 
 
 		 419 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  29.29 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  28.57 
 
 		 489 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  30.59 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1581  paraquat-inducible protein A  30 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  29.9 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  28.78 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  29.58 
 
 		 426 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  28.64 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2487  paraquat-inducible protein A  34 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00109447  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1446  Paraquat-inducible protein A  32.24 
 
 		 207 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  28.93 
 
 		 416 aa  98.2  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  31.78 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  32.51 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  30 
 
 		 429 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  27.18 
 
 		 402 aa  97.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  31.48 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  30.77 
 
 		 422 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>