210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1572 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 208 aa  420  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  43.5 
 
 		 221 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  42.93 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  41.62 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  42.05 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  36.89 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  37.68 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  41.92 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  37.44 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  37.44 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  36.89 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  37.07 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  38.35 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  42.79 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  37.2 
 
 		 449 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  36.84 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  40.91 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  40.91 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  40.91 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  40.91 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  40.91 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  40.91 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  44.1 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  39.81 
 
 		 423 aa  141  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  37.32 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  41.58 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  44.61 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  40.39 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  37.86 
 
 		 460 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  32.99 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  33.67 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  42.27 
 
 		 449 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  33.5 
 
 		 198 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  36.36 
 
 		 462 aa  117  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  43.46 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  33.16 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  30.1 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  34.18 
 
 		 292 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  29.59 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  30.35 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  31.61 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  35.16 
 
 		 406 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  29.15 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  27.88 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  29.76 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  28.28 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  32.74 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  32.81 
 
 		 259 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  26.77 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  27.18 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  31.11 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  29.59 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  32.29 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  29.23 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  27.4 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  26.26 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  29.44 
 
 		 219 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  27.64 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  25.76 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  28.93 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  27.78 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  30.43 
 
 		 405 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  29.95 
 
 		 464 aa  90.1  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  29.08 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  32.85 
 
 		 415 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  28.12 
 
 		 413 aa  88.6  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  29.53 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  32.85 
 
 		 415 aa  89  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  27.04 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  30.58 
 
 		 428 aa  87.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  30.58 
 
 		 428 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  29.17 
 
 		 448 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  26.73 
 
 		 444 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  30.5 
 
 		 458 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  26.6 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  30.1 
 
 		 428 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  29.02 
 
 		 489 aa  85.1  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  30.96 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  24.62 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  30.39 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  25.24 
 
 		 434 aa  81.6  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  26.94 
 
 		 417 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  26.94 
 
 		 417 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  27.72 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  29.23 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  23.12 
 
 		 419 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  25.25 
 
 		 423 aa  79  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  26.42 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  26.42 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  26.42 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  26.42 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  26.42 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  25.14 
 
 		 426 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  26.42 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  26.42 
 
 		 417 aa  79  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  27.41 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  25.14 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  24.86 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1580  paraquat-inducible protein A  27.03 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.230902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>