211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0401 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 221 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  62.36 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  54.73 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  43.96 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  51.55 
 
 		 449 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  55.26 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  53.06 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  44.21 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  42.86 
 
 		 251 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  44.21 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  44.21 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  43.35 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  43.68 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  40.58 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  41.89 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  41.06 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  43.5 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  54.12 
 
 		 200 aa  164  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  42.18 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  40.78 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  43.08 
 
 		 245 aa  157  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  42.23 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  45.31 
 
 		 423 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  42.23 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  42.23 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  42.23 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  42.23 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  42.23 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  41.63 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  38.16 
 
 		 449 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  38.65 
 
 		 292 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  37.68 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  38.86 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  40.62 
 
 		 460 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  37.68 
 
 		 259 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  36.84 
 
 		 212 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  35.05 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  35.57 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  37.85 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  41.11 
 
 		 462 aa  121  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  36.84 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  35.42 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  36.84 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  36.89 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  36.11 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  34.21 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  35.38 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  35.38 
 
 		 235 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  33 
 
 		 413 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  35.05 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  30.41 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  35.5 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  34.98 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  28.3 
 
 		 434 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  33.68 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  30.26 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  32.12 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  31.25 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  31 
 
 		 207 aa  95.1  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  32.29 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  31.28 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  31.07 
 
 		 444 aa  92.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  28.29 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  28.65 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  30.77 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  30.65 
 
 		 205 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  31.91 
 
 		 458 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  29.35 
 
 		 406 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  29.7 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  26.29 
 
 		 220 aa  89  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  26.29 
 
 		 419 aa  88.6  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  27.23 
 
 		 405 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  29.27 
 
 		 489 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  28.9 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  28.27 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  25 
 
 		 417 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  30.48 
 
 		 464 aa  86.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  25 
 
 		 417 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  25.87 
 
 		 423 aa  86.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  30.93 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  31.25 
 
 		 205 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  31.25 
 
 		 205 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  28.28 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  27.94 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  28.49 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  26.56 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  24.47 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  24.47 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  24.47 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  24.47 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  24.47 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  24.47 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  24.47 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  24.47 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  28.14 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  30.29 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  27.46 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  27.95 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  28.22 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>