210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2533 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 245 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  76.08 
 
 		 261 aa  318  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  67.36 
 
 		 251 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  63.81 
 
 		 221 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  64.5 
 
 		 221 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  64.5 
 
 		 221 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  64.5 
 
 		 221 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  68.5 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  63.5 
 
 		 220 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  63.5 
 
 		 220 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  62.5 
 
 		 218 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  62.5 
 
 		 218 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  62.5 
 
 		 218 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  62.5 
 
 		 218 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  62.5 
 
 		 218 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  62.5 
 
 		 218 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  64.5 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  54.55 
 
 		 449 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  46.22 
 
 		 460 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  46.67 
 
 		 223 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  44.16 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  43.59 
 
 		 462 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  43.08 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  45.26 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  45.76 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  39.34 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  44.94 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  46.91 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  37.82 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  36.79 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  35.23 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  41.45 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  45.61 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  32.63 
 
 		 215 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  36.55 
 
 		 219 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  33.68 
 
 		 198 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  31.05 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  34.52 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  35.53 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  31.61 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  33.5 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  32.49 
 
 		 235 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  33.6 
 
 		 423 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  32.99 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  34.2 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  34.69 
 
 		 449 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  32.49 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  26.94 
 
 		 405 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  35.03 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  32.2 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  28.44 
 
 		 406 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  29.02 
 
 		 198 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  28.87 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  34.36 
 
 		 413 aa  95.5  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  29.47 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  30.73 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  28.95 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  28 
 
 		 434 aa  91.3  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  27.72 
 
 		 464 aa  89  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  30.15 
 
 		 423 aa  88.6  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  25.94 
 
 		 402 aa  88.6  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  28.21 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  28.5 
 
 		 199 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  25.45 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  30.68 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  27.55 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  29.79 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  29.79 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  25.68 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  28.64 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  27.23 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  25.85 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  29.65 
 
 		 444 aa  82  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  24.62 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  26.4 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  25.89 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  27.41 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  28.64 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  28.24 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  28.72 
 
 		 429 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  29.02 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  25.89 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  28.14 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  29.59 
 
 		 426 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  26.8 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  26.02 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  25.63 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  25.89 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  29.71 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1842  integral membrane protein, PqiA family  31.29 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  23.9 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  29.95 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2232  paraquat-inducible protein A  23.79 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  29.34 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  28.42 
 
 		 448 aa  75.9  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  26.56 
 
 		 427 aa  75.5  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  24.37 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  26.4 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  25.38 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2077  integral membrane protein, PqiA family  30.73 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>