207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3327 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2693  paraquat-inducible protein A  59.9 
 
 		 219 aa  238  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  59.07 
 
 		 204 aa  234  9e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  48.22 
 
 		 401 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  42.64 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  44.55 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  41.46 
 
 		 207 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  41.95 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  41.95 
 
 		 207 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  44.78 
 
 		 444 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  45.69 
 
 		 426 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  46.49 
 
 		 426 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  42.71 
 
 		 414 aa  164  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  41.84 
 
 		 423 aa  165  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  42.42 
 
 		 422 aa  164  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  40.89 
 
 		 205 aa  164  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  42.86 
 
 		 448 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  45.95 
 
 		 426 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  41.75 
 
 		 458 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  39.5 
 
 		 428 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  39.5 
 
 		 428 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  39.5 
 
 		 428 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  41.21 
 
 		 415 aa  161  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  40.3 
 
 		 417 aa  160  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  40.3 
 
 		 417 aa  160  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  40.3 
 
 		 417 aa  160  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  40.3 
 
 		 417 aa  160  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  40.3 
 
 		 417 aa  160  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  40.3 
 
 		 417 aa  160  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  46.49 
 
 		 427 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  41.21 
 
 		 415 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  40.3 
 
 		 417 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  40.4 
 
 		 417 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  40.3 
 
 		 417 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  39.42 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  39.51 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  41.03 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  45.18 
 
 		 434 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  45.14 
 
 		 449 aa  158  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  41.62 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  40.4 
 
 		 417 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  40.1 
 
 		 423 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  40.4 
 
 		 417 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  40.4 
 
 		 417 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  40.4 
 
 		 417 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  40.4 
 
 		 417 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  41.03 
 
 		 417 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  45.81 
 
 		 406 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  39.81 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  42.13 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  41.71 
 
 		 422 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  42.86 
 
 		 380 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  42.71 
 
 		 413 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1446  Paraquat-inducible protein A  40.31 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2581  paraquat-inducible protein A  42.5 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  40.7 
 
 		 464 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  41.24 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  37.13 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  37.11 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  38.61 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  38.61 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  37.82 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  41.24 
 
 		 252 aa  147  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  42.16 
 
 		 210 aa  147  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  39.13 
 
 		 216 aa  147  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  43.82 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  42.78 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  40.68 
 
 		 405 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  40.1 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  40.39 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  37.9 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  38.58 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  36.27 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2207  paraquat-inducible protein A  40.31 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  44.65 
 
 		 402 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  41.84 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  38.07 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  39.79 
 
 		 205 aa  141  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  39.79 
 
 		 205 aa  141  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  39.8 
 
 		 449 aa  141  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  36.9 
 
 		 408 aa  140  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  38.78 
 
 		 417 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  39.27 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  39.18 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  40.31 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2445  paraquat-inducible protein A  39.27 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00132645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  39.27 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2452  paraquat-inducible protein A  39.27 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.241615  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2565  paraquat-inducible protein A  39.27 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.56837  normal  0.166721 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  39.6 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  39.6 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2222  paraquat-inducible protein A  34.85 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00958061  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  38.73 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1717  paraquat-inducible protein A  36.9 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000226813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  38.22 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1930  paraquat-inducible protein A  36.13 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134385  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  33.88 
 
 		 419 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1580  paraquat-inducible protein A  38.46 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.230902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  40.2 
 
 		 209 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2488  paraquat-inducible protein A  35.9 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0028453  normal  0.335201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>