208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2488 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2488  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0028453  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  78.4 
 
 		 216 aa  347  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2452  paraquat-inducible protein A  76.47 
 
 		 205 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.241615  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2565  paraquat-inducible protein A  76.47 
 
 		 205 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.56837  normal  0.166721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2445  paraquat-inducible protein A  76.47 
 
 		 205 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00132645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  75.49 
 
 		 205 aa  317  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  75.98 
 
 		 205 aa  317  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2207  paraquat-inducible protein A  74.51 
 
 		 210 aa  316  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  75 
 
 		 205 aa  315  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  75 
 
 		 205 aa  315  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1797  paraquat-inducible protein A  74.29 
 
 		 210 aa  315  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0702887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1930  paraquat-inducible protein A  72.91 
 
 		 213 aa  309  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134385  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2233  paraquat-inducible protein A  71.77 
 
 		 237 aa  308  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.80452  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1580  paraquat-inducible protein A  72.55 
 
 		 209 aa  298  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.230902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1717  paraquat-inducible protein A  71.64 
 
 		 213 aa  295  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000226813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2222  paraquat-inducible protein A  47.42 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00958061  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  44.88 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  46.28 
 
 		 419 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  45.59 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  42.93 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  42.44 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  43.9 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  47.57 
 
 		 416 aa  168  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  44.66 
 
 		 206 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  43.9 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  42.65 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  42.44 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  44.33 
 
 		 324 aa  164  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  41.36 
 
 		 408 aa  161  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  44.44 
 
 		 450 aa  151  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  38.12 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  44.44 
 
 		 415 aa  151  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  44.44 
 
 		 450 aa  151  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  39.11 
 
 		 444 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2077  integral membrane protein, PqiA family  45.05 
 
 		 427 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  47.03 
 
 		 429 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  46.49 
 
 		 426 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2116  PqiA family integral membrane protein  42.71 
 
 		 416 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.327223  decreased coverage  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  41 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1842  integral membrane protein, PqiA family  46.78 
 
 		 454 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  39.39 
 
 		 427 aa  141  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  44.63 
 
 		 427 aa  141  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  39.09 
 
 		 423 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  42.86 
 
 		 427 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  43.5 
 
 		 427 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  43.5 
 
 		 427 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  43.5 
 
 		 427 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  43.5 
 
 		 427 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  43.5 
 
 		 427 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  43.5 
 
 		 412 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  42.94 
 
 		 427 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  37.81 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  38.27 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  38.57 
 
 		 449 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  42.94 
 
 		 427 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1467  PqiA family integral membrane protein  41.81 
 
 		 427 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00123019  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1991  integral membrane protein, PqiA family  41.81 
 
 		 427 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.227718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1987  integral membrane protein PqiA family  41.81 
 
 		 427 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  hitchhiker  0.00476807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1283  integral membrane protein, PqiA family  41.81 
 
 		 427 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000216228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2049  hypothetical protein  41.81 
 
 		 427 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  41.5 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  43.43 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  37.69 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  37.11 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  38.89 
 
 		 426 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  33.17 
 
 		 428 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  33.17 
 
 		 428 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  33.17 
 
 		 428 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2693  paraquat-inducible protein A  36.63 
 
 		 219 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  40.61 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  40.5 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  38.27 
 
 		 426 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  38.68 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  40.5 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  40.5 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  35.9 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  40.4 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  34.42 
 
 		 417 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  34.42 
 
 		 417 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  36.41 
 
 		 423 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  34.78 
 
 		 415 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  38.31 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  34.78 
 
 		 415 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  34.78 
 
 		 414 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  33.95 
 
 		 417 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  33.95 
 
 		 417 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  33.95 
 
 		 417 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  33.95 
 
 		 417 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  40 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  36.65 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  33.95 
 
 		 417 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  33.95 
 
 		 417 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  33.95 
 
 		 417 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  39.04 
 
 		 464 aa  128  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  40 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  40 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  35.32 
 
 		 448 aa  127  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  36.73 
 
 		 413 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  40.38 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  35.71 
 
 		 426 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>