213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2693 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2693  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  59.9 
 
 		 201 aa  238  5.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  54.46 
 
 		 204 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  45.7 
 
 		 444 aa  175  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  48.17 
 
 		 427 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  48.17 
 
 		 426 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  47.89 
 
 		 426 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  43.46 
 
 		 401 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  42.99 
 
 		 426 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  46.77 
 
 		 434 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  46.53 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  43.37 
 
 		 423 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  42.53 
 
 		 415 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  43.54 
 
 		 415 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  44.91 
 
 		 417 aa  164  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  44.91 
 
 		 417 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  44.44 
 
 		 417 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  44.44 
 
 		 417 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  44.44 
 
 		 417 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  44.44 
 
 		 417 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  44.44 
 
 		 417 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  44.44 
 
 		 417 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  44.44 
 
 		 417 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  43.06 
 
 		 414 aa  161  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  44.5 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  41.31 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  44.39 
 
 		 449 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  41.31 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  39.01 
 
 		 428 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  42.34 
 
 		 417 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  39.01 
 
 		 428 aa  154  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  39.01 
 
 		 428 aa  154  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  41.31 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  40.38 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  42.13 
 
 		 252 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  42.29 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  43.14 
 
 		 417 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  43.14 
 
 		 417 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  43.14 
 
 		 417 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  42.19 
 
 		 458 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  42.19 
 
 		 448 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  43.14 
 
 		 417 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  43.14 
 
 		 417 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  39.49 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  41.79 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  40.28 
 
 		 423 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  42.08 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  42.23 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  39.29 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  44.78 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  39.21 
 
 		 422 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  41.12 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  43.02 
 
 		 449 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  43.5 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  39.52 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  43.28 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  43.28 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  44.78 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  38.1 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  39.05 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  45.15 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  46.67 
 
 		 402 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  40.89 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1446  Paraquat-inducible protein A  40.61 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  38.5 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  38.21 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  42.44 
 
 		 405 aa  141  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  43.4 
 
 		 406 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  42.71 
 
 		 422 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  40.95 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  39.18 
 
 		 464 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  42.53 
 
 		 380 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  39.25 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  39.25 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  39.25 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2581  paraquat-inducible protein A  40.67 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2488  paraquat-inducible protein A  36.63 
 
 		 213 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0028453  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  42.47 
 
 		 212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  39.05 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  37.84 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  38.91 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  39.13 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  39.42 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  40.3 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  39.52 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  37.84 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  37.84 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  37.84 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  37.84 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  36.13 
 
 		 408 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1580  paraquat-inducible protein A  35.75 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.230902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  38.05 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  42.29 
 
 		 462 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2207  paraquat-inducible protein A  35.32 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  34.87 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  34.87 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  34.87 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  34.87 
 
 		 205 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1717  paraquat-inducible protein A  34.83 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000226813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>