210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003029 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 401 aa  821    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  89.03 
 
 		 426 aa  726    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  65.79 
 
 		 434 aa  527  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  53.58 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  53.17 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  52.38 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  42.56 
 
 		 444 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  44.26 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  41.18 
 
 		 413 aa  266  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  39.64 
 
 		 422 aa  264  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  40.51 
 
 		 414 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  38.07 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  38.07 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  38.32 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  39.75 
 
 		 415 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  38.5 
 
 		 402 aa  255  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  39.85 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  38.89 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  39.49 
 
 		 415 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  39.9 
 
 		 458 aa  253  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  38.36 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  39.29 
 
 		 422 aa  249  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  39.73 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  39.73 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  39.73 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  39.73 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  39.73 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  39.73 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  39.73 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  39.73 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  39.46 
 
 		 417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  38.17 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  37.3 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  39.94 
 
 		 417 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  39.94 
 
 		 417 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  39.94 
 
 		 417 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  39.94 
 
 		 417 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  39.94 
 
 		 417 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  36.49 
 
 		 423 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  32.77 
 
 		 449 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  51.04 
 
 		 205 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  33.33 
 
 		 449 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  45.89 
 
 		 224 aa  195  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  46.19 
 
 		 208 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  34.29 
 
 		 462 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  32.28 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  44.78 
 
 		 220 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  46.07 
 
 		 206 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  45.45 
 
 		 212 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  42.38 
 
 		 216 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  46.07 
 
 		 206 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  44.5 
 
 		 209 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  48.22 
 
 		 201 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  43.72 
 
 		 207 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  43.46 
 
 		 206 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  42.64 
 
 		 207 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  42.64 
 
 		 207 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  31.22 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  42.64 
 
 		 207 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  42.64 
 
 		 207 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2693  paraquat-inducible protein A  43.46 
 
 		 219 aa  170  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  43.75 
 
 		 220 aa  169  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  41.83 
 
 		 214 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  44.5 
 
 		 211 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  44.5 
 
 		 211 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  44.5 
 
 		 211 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  44.06 
 
 		 213 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  43.41 
 
 		 220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  29.81 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  29.81 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  44 
 
 		 209 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  43.14 
 
 		 204 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  43.37 
 
 		 209 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  40 
 
 		 249 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  44.67 
 
 		 209 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  34.15 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  44.67 
 
 		 209 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  43.5 
 
 		 220 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  43.5 
 
 		 220 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  43.5 
 
 		 220 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  43.5 
 
 		 220 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  43.5 
 
 		 209 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  29.81 
 
 		 450 aa  159  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  26.09 
 
 		 489 aa  159  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  41.41 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2581  paraquat-inducible protein A  42.4 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  42.08 
 
 		 216 aa  158  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  43.2 
 
 		 215 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  40.59 
 
 		 245 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  33.45 
 
 		 429 aa  156  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  43.78 
 
 		 223 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  44.67 
 
 		 215 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  44.78 
 
 		 210 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  28.68 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  39.05 
 
 		 252 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  29.58 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  27.76 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  40.3 
 
 		 247 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  41.76 
 
 		 212 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  38.18 
 
 		 204 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>