214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1780 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  99.78 
 
 		 450 aa  914    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2116  PqiA family integral membrane protein  80.24 
 
 		 416 aa  644    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.327223  decreased coverage  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  100 
 
 		 450 aa  916    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  100 
 
 		 415 aa  842    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  70.56 
 
 		 429 aa  588  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  70.59 
 
 		 426 aa  586  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  67.07 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  66.75 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  66.75 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  67.31 
 
 		 412 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  66.27 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  66.27 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2049  hypothetical protein  67.23 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1467  PqiA family integral membrane protein  67.23 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00123019  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1987  integral membrane protein PqiA family  67.23 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  hitchhiker  0.00476807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  66.51 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  66.27 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  66.51 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1283  integral membrane protein, PqiA family  66.99 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000216228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  65.78 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1991  integral membrane protein, PqiA family  66.99 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.227718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2077  integral membrane protein, PqiA family  67.08 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1842  integral membrane protein, PqiA family  66.16 
 
 		 454 aa  533  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  43.2 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  38.11 
 
 		 416 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  37.86 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  39.21 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  39.43 
 
 		 324 aa  237  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  32.91 
 
 		 458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  32.2 
 
 		 422 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  33.97 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  32.34 
 
 		 422 aa  194  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  32.91 
 
 		 448 aa  193  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  32.52 
 
 		 423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  32.16 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  33.08 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  31.31 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  31.74 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  31.74 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  29.1 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  31.16 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  30.9 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  31.95 
 
 		 417 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  31.95 
 
 		 417 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  31.95 
 
 		 417 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  31.95 
 
 		 417 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  31.95 
 
 		 417 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  32.71 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  31.39 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  32.58 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  31.68 
 
 		 417 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  30.79 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  30.79 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  30.79 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  30.79 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  30.79 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  30.79 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  30.79 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  30.79 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  30.22 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  30.79 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  30.8 
 
 		 449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  29.01 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  28.99 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  29.06 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  29.08 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  28.64 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  31.92 
 
 		 413 aa  170  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  28.33 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  42.86 
 
 		 212 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  29.81 
 
 		 401 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  26.82 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2222  paraquat-inducible protein A  40.8 
 
 		 207 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00958061  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  45.92 
 
 		 205 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  45.92 
 
 		 205 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  45.73 
 
 		 206 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  45.73 
 
 		 206 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  45.41 
 
 		 205 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1797  paraquat-inducible protein A  44.62 
 
 		 210 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0702887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1930  paraquat-inducible protein A  41.23 
 
 		 213 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2207  paraquat-inducible protein A  46.63 
 
 		 210 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  40.78 
 
 		 216 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5823  paraquat-inducible protein A  30.56 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  44.22 
 
 		 206 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  42 
 
 		 212 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  44.5 
 
 		 207 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  44.16 
 
 		 209 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  31.25 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  40.82 
 
 		 204 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  45 
 
 		 207 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1580  paraquat-inducible protein A  42.44 
 
 		 209 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.230902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  43.22 
 
 		 208 aa  153  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  28.47 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2445  paraquat-inducible protein A  44.16 
 
 		 205 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00132645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2565  paraquat-inducible protein A  44.16 
 
 		 205 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.56837  normal  0.166721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1717  paraquat-inducible protein A  42.13 
 
 		 213 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000226813  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2488  paraquat-inducible protein A  44.44 
 
 		 213 aa  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0028453  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  44.72 
 
 		 205 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  43 
 
 		 207 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2452  paraquat-inducible protein A  43.65 
 
 		 205 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.241615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>